公司制度不能违反法律规定，你仍然有权主张加班费赔偿。针对你的情况，我们可以从以下几个方面来详细分析并主张你的权益：
一. 公司制度的合法性
- 公司制度不能凌驾于法律之上：根据《工资支付暂行规定》第十三条，用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，安排劳动者在法定标准工作时间以外工作的，应支付加班费。公司制度中“工作日多晚下班都不能提加班”的规定，显然与这一法规相悖。
- 我的观点：公司制度若与法律法规相冲突，应以法律法规为准。因此，尽管公司有此规定，但你仍有权根据法律规定主张加班费。
二. 主张加班费的依据
- 加班费的计算：根据《工资支付暂行规定》，工作日延长工作时间的加班费=加班费计算基数÷21.75÷8×加班时数×1.5倍。你需要收集加班的证据，如打卡记录、工作日志等，以计算应得的加班费。
- 法律支持：若公司拒绝支付加班费，你可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条，向劳动行政部门投诉，要求公司限期支付，并可能获得赔偿金。
三. 维权步骤
- 首先尝试与公司沟通：虽然公司制度有不合理之处，但首先建议与公司的人力资源部门或管理层沟通，表达你的诉求和法律依据，看是否能通过内部协商解决。
- 向劳动行政部门投诉：如果公司不予理会，你可以向当地的劳动行政部门投诉，提交加班证据和诉求，要求调查并处理。
- 法律途径：若投诉无果，你可以根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，申请劳动仲裁。仲裁不予受理或仲裁不公时，还可以在15天内向法院提起民事诉讼。
四. 注意事项
- 保留证据：在整个过程中，务必保留好所有与加班相关的证据，如工作记录、打卡记录、沟通记录等。
- 时效问题：注意劳动仲裁和诉讼的时效问题，确保在法定时间内主张你的权益。
我建议你首先尝试与公司沟通，明确表达你的诉求和法律依据。如果公司不予配合，再依次通过劳动行政部门、劳动仲裁和诉讼等途径来维护你的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。