如果公司查出来员工的探亲假是假的，这通常涉及到员工可能违反了公司的规章制度或相关法律法规，具体处理方式需根据实际情况和公司政策来定，但一般而言，公司可能会采取以下措施：

1. 依据公司规章制度处理：

   • 大多数公司都会制定有关于员工请假的规章制度，其中会明确规定探亲假的申请条件、审批流程以及虚假请假的后果。
   • 如果员工被查实探亲假是假的，公司有权根据规章制度对员工进行相应的处罚，如警告、罚款、扣减奖金、降职甚至解除劳动合同等。

2. 法律层面的考量：

   • 从法律角度来看，员工提供虚假信息骗取假期可能构成欺诈行为，虽然这不一定直接触犯刑法，但肯定违反了劳动合同中的诚实信用原则。
   • 如果员工的虚假请假行为给公司造成了经济损失，公司还有权要求员工承担赔偿责任。

3. 处理流程与建议：

   • 调查核实：公司应首先进行充分的调查，确保有确凿的证据证明员工的探亲假是假的。
   • 沟通协商：在采取处罚措施前，公司可以与员工进行沟通，了解其虚假请假的原因，看是否可以达成和解或给予改正的机会。
   • 正式处理：如果沟通无果或员工行为恶劣，公司应按照规章制度正式对员工进行处理，并确保处理过程合法合规。
   • 记录与备案：无论处理结果如何，公司都应做好相关记录并备案，以备未来可能出现的法律纠纷。

4. 预防与教育：

   • 为了避免类似情况的发生，公司应加强对员工的诚信教育，明确虚假请假的严重后果。
   • 同时，公司也可以优化请假流程，如要求提供更多的证明材料或进行更严格的审批，以减少虚假请假的可能性。

如果员工遇到此类问题，建议首先与公司进行诚恳的沟通，了解公司的具体要求和处罚措施，并尝试解释或纠正自己的行为。如果沟通无果或认为公司的处理不公，员工也可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。作为陈晓辉律师，我专注于公司事务和股权转让领域，如果你在此方面有任何法律问题，都可以直接向我咨询。