结论：两口子两年多没有同房且吵架后谈好签协议互不搭理，同时约定孩子抚养权归男方的做法，在法律上存在一定的问题和风险，不能简单地通过一纸协议来完全确定抚养权的归属。
法律分析：
抚养权归属的法律原则：
- 根据我国《民法典》的相关规定，父母对子女有抚养教育的义务。在离婚或分居等情况下，子女的抚养权归属应当遵循最有利于未成年子女的原则。这意味着，抚养权的确定不仅仅取决于父母双方的协议，更重要的是要考虑子女的实际需要、成长环境以及父母双方的抚养能力和条件。
协议的有效性：
- 虽然父母双方可以就子女的抚养问题达成协议，但这种协议必须符合法律的规定和原则，且不得损害子女的利益。如果协议内容违反了法律强制性规定或损害了子女的合法权益，那么该协议可能是无效的。例如，如果协议中约定了完全忽视子女需求或不利于子女成长的条款，这样的协议在法律上是不被认可的。
实际抚养情况的影响：
- 抚养权的确定不仅仅依赖于协议，还需要考虑父母双方的实际抚养情况。如果一方长期不履行抚养义务，或者存在不利于子女成长的情形（如虐待、遗弃等），那么另一方可以请求法院变更抚养权。因此，即使双方签订了协议，如果实际抚养情况发生了变化，抚养权也可能随之调整。
法律程序的重要性：
- 在涉及子女抚养权的问题上，仅仅依靠双方之间的协议是不够的。为了确保子女的权益得到保障，建议通过法律程序来明确抚养权的归属。这可以包括向法院提起诉讼或申请调解等。通过法律程序，可以确保抚养权的确定更加公正、合理，并且具有法律效力。
建议：
- 协商与调解：在双方能够友好协商的前提下，可以尝试通过调解的方式来解决抚养权问题。调解可以更加灵活地考虑双方的需求和子女的利益，达成一个双方都能接受的协议。
- 法律程序：如果协商无果或存在争议，建议通过法律程序来明确抚养权的归属。可以聘请专业律师来协助处理相关事宜，确保子女的权益得到最大程度的保障。
- 关注子女需求：在处理抚养权问题时，要始终将子女的需求和利益放在首位。无论最终抚养权归谁所有，都要确保子女能够在一个健康、稳定的环境中成长。
风险提示：
- 简单地通过一纸协议来确定抚养权的归属可能存在法律风险。如果协议内容违反了法律强制性规定或损害了子女的合法权益，那么该协议可能是无效的。
- 抚养权的确定是一个复杂而敏感的问题，需要综合考虑多种因素。因此，在处理此类问题时，建议寻求专业律师的帮助和指导。
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