员工在非工伤病休期满后仍不能上班，想要继续休假，可以按照以下步骤与公司进行协商和申请：

一、了解公司规章制度与劳动合同约定

1. 查阅公司规章制度：首先，员工应详细查阅公司的员工手册、休假政策等规章制度，了解关于病假、医疗期以及延长休假的具体规定。
2. 核对劳动合同：同时，核对劳动合同中是否有关于病假、医疗期以及延长休假的特别约定。劳动合同是员工与公司之间权利义务关系的重要依据。

二、与公司进行协商

1. 提前沟通：在病休期满前，员工应提前与公司的人力资源部门或直接上级进行沟通，说明自己的身体状况和无法按时返回工作岗位的原因。
2. 提交医疗证明：员工应提供由正规医院出具的医疗证明，证明自己确实需要继续休息和治疗。医疗证明应详细说明病情、治疗建议以及预计的休息时间。
3. 协商延长休假：基于医疗证明和公司的规章制度，员工可以与公司协商延长休假的时间。在协商过程中，员工应表达自己的诚意和合作态度，同时考虑公司的实际运营需求。

三、申请延长休假的具体方式

1. 书面申请：员工应向公司提交书面申请，明确说明延长休假的原因、时间以及提供的医疗证明。书面申请有助于保留证据，避免后续纠纷。
2. 遵循公司流程：按照公司的内部流程，将申请提交给相关部门或负责人进行审批。在审批过程中，员工应保持耐心，并随时准备提供进一步的医疗证明或解释。

四、可能面临的法律后果与应对策略

1. 公司拒绝延长休假：如果公司拒绝延长休假，员工应首先了解拒绝的原因。如果是因为公司规章制度或劳动合同中的明确规定，员工可能需要接受这一结果。但如果员工认为公司的决定不合理或违反了相关法律法规，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
2. 公司提出解除劳动合同：在极端情况下，如果公司认为员工长期无法履行工作职责，可能会提出解除劳动合同。此时，员工应仔细审查解除劳动合同的理由和程序是否合法。如果认为公司的行为违法，员工可以依法申请劳动仲裁或提起诉讼。

五、建议与注意事项

1. 保持沟通：在整个过程中，员工应与公司保持密切的沟通，及时了解公司的决定和反馈。
2. 保留证据：员工应妥善保管所有与休假相关的医疗证明、申请文件以及与公司的沟通记录等证据。
3. 寻求法律帮助：如果员工在协商或申请过程中遇到困难或疑问，可以及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。

员工在非工伤病休期满后仍不能上班时，应首先了解公司的规章制度和劳动合同约定，然后与公司进行协商并提交书面申请。在协商过程中，员工应提供充分的医疗证明并表达自己的诚意和合作态度。如果遇到困难或疑问，可以及时寻求法律帮助。