事业单位约定劳务费个税由本方承担，这一做法在法律上并不直接违规，但需结合具体情况和税法规定来综合判断其合规性。以下从不同角度为您详细分析：

1. 税法规定角度

• 个人所得税的纳税义务：根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，个人所得税以所得人为纳税义务人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。这意味着，从法律条文上看，个人所得税的纳税义务人是取得劳务费的个人，而支付劳务费的单位（如事业单位）则是扣缴义务人。
• 约定承担个税的合法性：虽然税法规定了纳税义务人和扣缴义务人，但并未禁止纳税义务人与扣缴义务人之间就税款的承担进行约定。因此，从税法条文本身来看，事业单位与个人约定由事业单位承担劳务费个税，并不直接违反税法规定。

2. 合同效力角度

• 合同自由原则：在民事法律关系中，合同双方享有合同自由，即可以在不违反法律、行政法规的强制性规定和不违背公序良俗的前提下，自由约定合同的内容。因此，事业单位与个人之间就劳务费个税的承担进行约定，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该约定就是有效的。
• 潜在风险：然而，需要注意的是，如果这种约定导致了国家税收的流失（例如，通过约定降低应纳税所得额以减少税款），或者违反了其他法律、行政法规的强制性规定（如涉及洗钱、逃税等违法行为），则该约定可能被认定为无效，甚至可能面临法律责任。

3. 实际操作角度

• 税务处理：在实际操作中，如果事业单位与个人约定由事业单位承担劳务费个税，那么事业单位在支付劳务费时，需要按照税法规定计算并代扣代缴个人所得税。如果事业单位未按照规定代扣代缴税款，可能会面临税务机关的处罚。
• 财务处理：此外，事业单位在财务处理上也需要将承担的个税作为一项费用进行核算，并确保其符合相关财务制度和会计准则的要求。

4. 建议与风险提示

• 明确约定：如果事业单位与个人确实需要就劳务费个税的承担进行约定，建议双方在合同中明确约定税款的承担方式、金额以及违约责任等条款，以避免后续产生纠纷。
• 合规性审查：在签订合同前，建议双方对约定的合规性进行审查，确保其不违反法律、行政法规的强制性规定，并咨询专业律师或税务师的意见。
• 税务申报与缴纳：无论税款由谁承担，事业单位都需要按照税法规定进行税务申报和缴纳工作，以确保合规性。

总结来看，事业单位约定劳务费个税由本方承担，在法律上并不直接违规，但需确保约定的合规性，并按照规定进行税务申报和缴纳工作。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。