针对您提出的问题，即项目已经竣工，但公司未经您允许将您的证书用于项目负责人，您有权采取以下措施：
与公司沟通协商：
- 首先，您可以尝试与公司进行沟通，明确表达您对公司未经允许使用您证书的行为的不满，并要求公司立即停止这种行为。
- 在沟通过程中，您可以要求公司出具书面说明，解释为何未经您同意使用您的证书，并要求公司承诺今后不再发生类似情况。
收集证据并准备法律行动：
- 如果公司拒绝沟通或不予理会您的要求，您需要开始收集相关证据，包括但不限于项目竣工文件、公司使用您证书的记录、您与公司之间的沟通记录等。
- 这些证据将有助于您在后续的法律行动中证明公司的违法行为，并维护您的合法权益。
向相关部门投诉或举报：
- 根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，未经注册执业人员同意，以其名义从事相关建筑活动的，属于违法行为。
- 您可以向当地的建设行政主管部门或相关监管机构投诉或举报公司的违法行为。这些部门有权对公司的违法行为进行调查，并依法给予行政处罚。
考虑法律诉讼：
- 如果公司的违法行为给您造成了经济损失或名誉损害，您可以考虑通过法律诉讼来维护自己的权益。
- 在提起诉讼前，建议您咨询专业律师，评估案件的胜诉可能性和赔偿金额，以便制定合理的诉讼策略。
在采取上述措施时，您需要注意以下几点：
- 保持冷静和理性：在处理此类问题时，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的行为或言论，以免影响问题的解决。
- 及时行动：一旦发现公司未经允许使用您的证书，应尽快采取行动。拖延时间可能会使问题变得更加复杂，增加解决的难度。
- 保护个人隐私和信息安全：在收集证据和与公司沟通的过程中，注意保护个人隐私和信息安全。避免泄露个人敏感信息或公司机密。
若公司行为构成侵权，您可能面临的法律后果及维权路径如下：
- 法律后果：公司未经您允许使用您的证书，可能构成对您姓名权、名誉权或执业资格的侵权。根据侵权行为的性质和后果，公司可能需要承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。
- 维权路径：您可以通过协商、投诉、举报或法律诉讼等途径来维护自己的权益。在选择维权路径时，应根据具体情况和自身需求来决定。
针对您可能关心的几个具体问题，我进一步说明如下：
如果公司拒绝停止使用我的证书怎么办？
- 如果公司拒绝停止使用您的证书，您可以继续向相关部门投诉或举报，并考虑通过法律诉讼来强制公司停止侵权行为。
我是否可以要求公司赔偿损失？
- 如果公司的侵权行为给您造成了经济损失或名誉损害，您有权要求公司赔偿损失。赔偿金额应根据实际损失情况来确定，并可能需要通过法律程序来确认。
我是否需要请律师来帮助我处理这个问题？
- 虽然您可以自己处理这个问题，但请律师来帮助您可能会更加专业和高效。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您更好地维护自己的权益。
最后，我建议您在处理此类问题时保持谨慎和理性，及时采取行动来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。