工业土地闲置两年，在符合法定条件的情况下，政府可以依法无偿收回该土地使用权，这一做法是合法的。以下是对此问题的详细解析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国土地管理法》第三十八条：

   • 明确规定禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。
   • 对于已办理审批手续的非农业建设占用耕地，若连续二年未使用，经原批准机关批准，县级以上人民政府可以无偿收回用地单位的土地使用权。

2. 《闲置土地处置办法》第二条及第十四条：

   • 定义了闲置土地，即超过国有建设用地使用权有偿使用合同或者划拨决定书约定、规定的动工开发日期满一年未动工开发的国有建设用地。
   • 对于未动工开发满两年的闲置土地，市、县国土资源主管部门有权报经有批准权的人民政府批准后，无偿收回国有建设用地使用权。

二、收回程序

1. 调查认定：

   • 市、县国土资源主管部门负责调查核实土地闲置情况，并向用地单位发出《闲置土地调查通知书》。
   • 用地单位需在规定时间内提供土地开发利用计划及相关说明材料。
   • 国土资源主管部门根据调查和用地单位提供的材料，认定是否构成闲置土地。

2. 拟定处置方案：

   • 对于认定为闲置的土地，市、县国土资源主管部门会拟定具体的处置方案，包括处置方式（如收回土地使用权）、处置理由和依据等。

3. 听取陈述申辩：

   • 在作出处置决定前，向用地单位送达《闲置土地处置听证告知书》，告知其有陈述、申辩和要求听证的权利。
   • 若用地单位要求听证，应在规定时间内提出书面申请，国土资源主管部门负责组织听证。

4. 作出处置决定：

   • 国土资源主管部门根据调查情况、处置方案及用地单位的陈述申辩意见，作出闲置土地处置决定。
   • 决定收回土地使用权的，向用地单位下达《收回国有建设用地使用权决定书》。

5. 注销登记：

   • 用地单位需在收到《收回国有建设用地使用权决定书》后30日内，到市、县国土资源主管部门办理土地使用权注销登记手续，并交回土地权利证书。
   • 若用地单位拒不办理，国土资源主管部门将公告注销其土地使用权登记和土地权利证书。

三、特殊情况处理

• 因不可抗力导致闲置：若因自然灾害、政府行为等不可抗力因素导致土地无法按期开发建设，用地单位可向国土资源主管部门申请延期开发，经批准后可不被认定为闲置土地或不被收回。
• 已采取措施消除闲置状态：在闲置土地处置过程中，若用地单位主动采取措施消除闲置状态，如加快项目建设进度、达到规定的开发建设要求等，并经国土资源主管部门认定，可不予收回土地使用权。

四、建议与结论

工业用地若因企业自身原因闲置满两年，将面临被无偿收回土地使用权的法律后果。因此，建议土地使用者应严格按照合同约定进行开发利用，避免土地闲置带来的法律风险和经济损失。若您对工业土地闲置或收回问题有任何疑问，欢迎直接向我咨询。