按日计工资的情况下，是否扣除休假工资主要取决于具体的工资计算方式以及劳动合同中的相关约定。以下是对此问题的详细分析：

1. 按日计工资且无额外约定

   • 在这种情况下，如果劳动者在休假日并未实际工作，且劳动合同或公司规章制度中没有特别约定休假日也支付工资，那么通常休假日是不计入工资的。因为按日计工资，本质上就是根据实际出勤的天数来计算工资，未出勤则无工资。

2. 按日计工资但有额外约定

   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定，即使劳动者在休假日未出勤，也按照一定比例或全额支付工资，那么休假日的工资就不会被扣除。这种约定通常是为了保障劳动者的基本生活需求或作为对劳动者的一种福利。

3. 特殊情况下的工资支付

   • 加班后调休：如果劳动者在休假日加班，并且之后用人单位安排了调休，那么调休的这一天虽然原本是休假日，但因为是对加班的补偿性休息，所以不影响工资的正常发放（若调休日按正常出勤计算工资）。不过，这通常是在月薪制下讨论的，按日计工资的情况下，若调休日未出勤且无额外约定，则可能无工资。但若调休是替代了原本应支付的加班费，且加班费已按法律规定支付，则不影响其他日期的工资计算。
   • 法定节假日：无论按日计工资还是月薪制，法定节假日都是带薪的，即劳动者即使未出勤，也应获得工资。这是因为法定节假日是劳动者的法定休息权利，且法律规定了这些日子应支付工资。

4. 注意事项

   • 劳动合同的约定：劳动合同是确定工资支付方式的重要依据。如果合同中有明确规定休假日的工资支付方式，那么应按照合同约定执行。
   • 地区差异：不同地区对于工资支付的具体规定可能存在细微差异。因此，在实际操作中，应以当地法律法规为准。

建议：

• 如果您对自己的工资计算方式存在疑问，或者认为用人单位在工资支付上存在违法行为，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。
• 同时，建议您仔细阅读劳动合同中的相关条款，了解自己的权利和义务，以便在发生纠纷时能够更好地维护自己的合法权益。