水利工程未进行合同完工验收，项目经理一般不算有在建工程，但具体需视合同约定及实际工程状态而定。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度
合同明确约定完工验收为在建工程界定标准：
- 若水利工程合同中明确规定，以合同完工验收作为判断项目经理是否承担在建工程的依据，那么在未进行合同完工验收的情况下，项目经理通常仍被视为承担在建工程。这是因为合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力，双方应严格按照合同约定履行各自义务。
合同未明确约定完工验收为在建工程界定标准：
- 若合同中未明确提及完工验收作为判断标准，则需要结合行业惯例、交易习惯以及实际工程状态进行综合判断。在这种情况下，未进行合同完工验收并不必然意味着项目经理承担在建工程。
实际工程状态角度
工程实际已完工但未验收：
- 如果水利工程实际上已经完工，只是由于各种原因（如资料不全、验收程序复杂等）导致未进行合同完工验收，那么从实际工程状态来看，项目经理可能不再承担在建工程的管理责任。然而，这并不意味着项目经理可以完全摆脱与该工程的关联，因为在实际操作中，可能还需要配合进行验收工作或处理后续事宜。
工程未实际完工：
- 如果水利工程尚未完工，那么无论是否进行合同完工验收，项目经理都显然承担在建工程的管理责任。在这种情况下，项目经理需要继续履行合同义务，确保工程按时、按质、按量完成。
法律建议
审查合同条款：
- 项目经理应首先审查水利工程合同中的相关条款，明确合同中关于在建工程界定、完工验收程序以及责任承担等方面的约定。这有助于项目经理准确判断自己的法律地位和责任范围。
与业主沟通协商：
- 如果合同中未明确约定或存在争议，项目经理应积极与业主进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。在沟通过程中，项目经理可以提供实际工程状态的相关证据，以支持自己的观点。
寻求法律支持：
- 如果项目经理与业主无法达成一致意见，或者认为自己的合法权益受到侵害，可以寻求法律支持。在这种情况下，项目经理可以咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务，以及可能采取的法律措施。
可能法律后果：若因未进行合同完工验收而导致项目经理被错误地认定为承担在建工程，可能会给项目经理带来不必要的法律责任和经济损失。例如，项目经理可能需要继续履行合同义务、承担违约责任或赔偿损失等。因此，项目经理应高度重视合同完工验收工作，确保自己的合法权益得到保障。
综上所述，水利工程未进行合同完工验收时，项目经理是否算有在建工程需视合同约定及实际工程状态而定。项目经理应审查合同条款、与业主沟通协商并寻求法律支持，以准确判断自己的法律地位和责任范围。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。