结论：关于项目经理在投标时有在建工程，但在签合同时无在建工程的情况，是否算作有在建工程，需结合具体法律法规、招标文件要求及合同条款综合判断。一般来说，若招标文件或相关法律法规明确规定项目经理在投标时不得有在建工程，则投标时存在在建工程即构成违规；若仅规定签合同时不得有在建工程，则需根据实际情况判断。以下从不同角度详细分析：
一、法律法规层面
《注册建造师执业管理办法》：
- 该办法明确规定，注册建造师不得同时在两个及以上建设工程项目上担任施工单位项目负责人。这意味着，如果项目经理在投标时已经在另一个项目上担任项目负责人，那么其参与新项目投标即违反了此规定。
地方建筑市场管理规定：
- 许多地方建设主管部门对项目经理在建工程情况进行严格监管，通常规定一个项目经理原则上只能同时负责一个在建工程项目。这些规定可能因地区而异，但普遍强调项目经理的唯一性和专注性。
二、招标文件要求
投标时要求：
- 许多招标项目的招标文件中会明确规定，拟派项目经理在投标时不得有在建项目。这是为了确保项目经理能够全身心投入新项目，避免精力分散导致的项目风险。如果招标文件有此要求，而项目经理在投标时存在在建工程，则构成违规。
签合同时要求：
- 部分招标文件可能仅规定签合同时项目经理不得有在建工程。在这种情况下，如果项目经理在投标时有在建工程，但在签合同时已经完成或解除，则可能不构成违规。然而，这需要具体查看招标文件的规定，并确保项目经理能够提供充分的证明材料。
三、合同条款与违约责任
合同条款：
- 如果中标合同中明确约定了项目经理在签合同时不得有在建工程，而项目经理违反了此约定，则构成违约。根据合同条款，违约方可能需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
法律后果：
- 除了合同违约责任外，项目经理还可能面临行政处罚，如警告、罚款、限制市场准入等。此外，如果因项目经理的违规行为给项目或相关方造成损失，项目经理及其所属企业还需承担相应的民事赔偿责任。
四、实际操作建议
仔细审查招标文件：
- 在参与投标前，务必仔细审查招标文件，了解其对项目经理在建工程的具体要求。如果招标文件有明确规定，应确保项目经理符合相关要求。
及时查询与更新信息：
- 利用官方渠道（如四库一平台）或专业招投标信息查询平台，及时查询项目经理的在建项目情况。在投标前和签合同前，都应进行查询，以确保信息的准确性。
与招标方沟通：
- 如果对招标文件的要求存在疑问或不确定，应及时与招标方沟通，明确相关要求。在签合同前，如果项目经理的在建项目情况发生变化，也应及时与招标方沟通，确保合同的顺利履行。
制定应急预案：
- 提前评估可能面临的法律风险，制定相应的应急预案和应对策略。例如，如果项目经理在投标时有在建工程，但预计在签合同前能够完成或解除，应提前准备相关证明材料，并与招标方沟通确认。
总结与建议：项目经理在投标时有在建工程，但在签合同时无在建工程的情况是否算作有在建工程，需结合具体法律法规、招标文件要求及合同条款综合判断。为确保合规性并降低潜在风险，建议企业在参与投标前仔细审查招标文件、及时查询与更新项目经理的在建项目情况、与招标方保持密切沟通，并制定应急预案以应对可能出现的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。