事业单位解除聘任合同并清退员工，员工是否有经济补偿，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、有经济补偿的情况
单位违法解除或终止合同：
- 如果事业单位违法解除或终止聘任合同，例如未按照法定程序进行解除，或者解除理由不合法，那么员工有权要求经济补偿。
非员工原因导致的解聘：
- 如果解聘不是由于员工的原因，如单位被撤销、解散等，单位应当向员工支付经济补偿。
双方协商一致解除合同：
- 如果事业单位提出解除聘任合同，并且员工同意，那么单位应当按照员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付经济补偿。工作年限六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的工资是指员工在劳动合同解除前十二个月的平均工资。
二、无经济补偿的情况
员工严重违反单位规章制度：
- 如果员工有严重违反单位规章制度等法定情形，被单位解聘，那么员工一般无权要求经济补偿。
员工受到开除处分：
- 如果员工受到开除处分，那么根据相关规定，员工也无权要求经济补偿。
三、经济补偿的计算与支付
- 经济补偿金的计算标准通常按照员工在单位的工作年限来确定，每满一年支付一个月工资。如果单位未支付经济补偿，员工可以通过向单位的主管部门反映情况或者向劳动人事争议仲裁机构申请仲裁等合法途径来维护自己的权益。
四、建议与注意事项
- 保留证据：员工在面临解聘时，应保留好相关证据，如聘任合同、解聘通知、工资单等，以便在需要时证明自己的权益。
- 及时咨询：如果员工对解聘或经济补偿有疑问，应及时咨询专业律师或相关机构，以了解自己的权益和可行的维权途径。
- 合法维权：员工在维权过程中应遵守法律法规，通过合法途径来维护自己的权益，避免采取过激行为。
举例说明：假设某员工在事业单位工作了五年，因单位原因被解聘，且解聘程序合法。那么，该员工有权要求单位支付五个月工资的经济补偿。如果单位未支付，员工可以通过劳动仲裁等途径来维护自己的权益。
综上所述，事业单位解除聘任合同并清退员工时，员工是否有经济补偿取决于解聘的原因和程序。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。