针对您提出的“员工自离老板还给员工发工资了怎么办”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析和解答：
一、员工自离与工资支付的基本原则
首先，需要明确的是，员工自离并不意味着他们就丧失了获取工资的权利。根据劳动法的相关规定，只要员工实实在在地提供了劳动，他们就有权利获得与之对应的报酬。这是劳动法保护劳动者基本权益的重要体现。
二、自离原因与工资支付的关系
单位过错导致自离：如果是因为单位本身存在过错，如未按时支付工资、未提供必要的劳动条件等，导致员工不得不选择自离，那么单位仍然需要支付员工应得的工资。
员工个人原因自离：如果员工是因为个人原因（如找到更好的工作、家庭原因等）而自离，且没有给单位造成经济损失，那么单位同样需要支付员工应得的工资。
三、自离给单位造成损失的处理
如果员工自离的行为给单位带来了经济上的损失，单位可以依照合法的规章制度，从员工的工资里扣除一部分来作为赔偿。但需要注意的是，扣除之后的工资不能低于当地规定的最低工资标准。这是为了保护劳动者的基本生活需求。
四、工资多发或误发的处理
针对您提到的“老板还给员工发工资了”这一情况，如果这是由于单位误发或多发了工资，那么单位有权要求员工返还多发的部分。具体处理步骤如下：
及时联系员工：单位应及时与员工取得联系，明确告知多发工资的情况及金额，要求其返还。沟通时，建议保留聊天记录、通话录音等证据，以备后续需要。
发送书面催款函：如果员工承认但拖延返还，单位可以发送书面催款函，明确返还期限及逾期后果。这有助于增强催款的正式性和有效性。
提起民事诉讼：如果员工拒绝返还，单位可以收集能证明多发工资的证据（如工资发放记录、财务报表、劳动合同等），向法院提起民事诉讼。法院判决后，如果员工仍不履行，单位可以申请强制执行。
报案处理：在极端情况下，如果金额较大且员工拒不返还，还可能构成侵占罪。此时，单位可以向公安机关报案，寻求法律帮助。
五、建议与总结
加强内部管理：为了避免类似情况的发生，单位应加强内部管理，完善工资发放流程，确保工资的准确性和及时性。
与员工友好协商：在处理此类问题时，单位应尽量与员工进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
依法维护权益：如果协商无果，单位应依法维护自己的权益，通过法律途径解决争议。
综上所述，员工自离后，如果单位误发或多发了工资，单位有权要求员工返还。在处理此类问题时，单位应遵循法律法规，与员工进行友好协商，并依法维护自己的权益。