若公司不承认员工在其子公司上班算连续工作，员工可以从以下几个方面来维护自己的权益：
收集并保留证据：
- 劳动合同：首先，要确认自己与子公司或母公司之间是否签订了劳动合同，以及合同中是否明确了工作地点、岗位等信息。如果合同中有明确条款表明在子公司工作属于母公司的工作安排，这将是一个有力的证据。
- 工作记录：保留在子公司工作期间的工作记录，如考勤记录、工作任务分配、工作成果等，这些都能证明你实际在子公司工作的事实。
- 沟通记录：与母公司或子公司之间的沟通记录，如邮件、微信聊天记录等，特别是那些涉及工作安排、薪资发放等方面的沟通，都能作为证据。
- 证人证言：如果有同事或上级能证明你在子公司工作的事实，他们的证言也将是有力的证据。
明确法律关系：
- 关联企业认定：根据《公司法》及相关司法解释，母公司与子公司之间虽然存在股权关系，但在法律上是独立的法人实体。然而，如果母公司对子公司有实际的控制权，且你的工作安排是由母公司决定的，那么从劳动法的角度来看，这种工作关系可能被视为连续工作。
- 劳动合同履行地：根据《劳动合同法》的规定，劳动合同履行地与用人单位注册地不一致的，有关劳动者的最低工资标准、劳动保护、劳动条件、职业危害防护和本地区上年度职工月平均工资标准等事项，按照劳动合同履行地的有关规定执行。这意味着，即使你的劳动合同是与母公司签订的，但如果你实际在子公司工作，那么子公司的所在地可能被视为劳动合同履行地。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 劳动仲裁：如果与公司协商无果，你可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求确认你在子公司的工作时间应计入连续工作时间，并据此主张相应的权益，如经济补偿、年假等。
- 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，你还可以向法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的权益。
注意事项：
- 时效性：根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，要及时行使自己的权利，避免超过时效期间。
- 专业咨询：在整个过程中，如果遇到法律难题或不确定如何操作，建议及时咨询专业律师，以确保自己的权益得到最大程度的保护。
行动建议：
- 首先，尝试与公司进行友好协商，明确你在子公司的工作时间应计入连续工作时间，并据此主张相应的权益。
- 如果协商无果，及时收集并保留相关证据，准备申请劳动仲裁或提起诉讼。
- 在整个过程中，保持冷静和理性，避免采取过激行为影响自己的权益。
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