小包工头因工人干活质量克扣工资不合法。

一. 克扣工资需依法进行

1. 工资支付原则：根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这表明，工资的支付应当遵循法定原则，不得随意克扣。
2. 克扣工资的法定情形：根据相关规定，用人单位可以代扣劳动者工资的情形包括代扣代缴个人所得税、社会保险费等，以及法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等。但因工人干活质量问题而克扣工资，并不属于这些法定情形。

二. 工人干活质量问题应另行处理

1. 质量问题与工资支付的关系：工人干活的质量问题属于工作履行中的瑕疵，应当通过工作评价、绩效考核等制度来处理，而不是直接克扣工资。
2. 合法处理方式：如果工人确实存在工作质量问题，小包工头可以与工人进行协商，通过扣减奖金、绩效等方式来体现对工作质量的不满，但不得直接克扣基本工资。

三. 克扣工资的法律后果

1. 违法责任：如果小包工头无故克扣工人工资，将承担违法责任，包括被劳动行政部门责令支付工资、经济补偿等，甚至可能面临行政处罚。
2. 损害工人权益：克扣工资会损害工人的合法权益，影响工人的生活和工作积极性，甚至可能导致劳动关系紧张，引发劳动争议。

我建议：小包工头应当遵守劳动法律法规，不得因工人干活质量问题而克扣工资。如果工人确实存在工作质量问题，应当通过合法途径进行处理，如与工人协商、扣减奖金或绩效等。如有进一步需要，您可以继续咨询我。