单位在休息日仅发放日工资是否违法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、标准工时制下的情况
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
违法性判断：
- 若单位实行标准工时制，在休息日安排员工加班却未能安排补休，仅发放正常日工资，未支付两倍工资，则构成违法。
法律后果：
- 劳动者有权要求单位补发差额工资，并可向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
二、不定时工作制或综合计算工时工作制下的情况
法律规定：
- 对于实行不定时工作制或综合计算工时工作制的单位，若已获得劳动行政部门的批准，其工资支付方式可能不同于标准工时制。
违法性判断：
- 在此类工时制度下，单位仅发放休息日工资并不必然构成违法。具体是否违法，需结合劳动合同、单位规章制度以及劳动行政部门的批准文件进行综合判断。
建议：
- 劳动者应仔细审查劳动合同和单位规章制度，了解自身在休息日工作的权益。若认为单位行为违法，可咨询专业律师或向劳动行政部门投诉。
三、单位违法时的责任追究
责任类型：
- 若单位在休息日仅发放日工资的行为构成违法，其可能承担的责任包括补发工资、支付赔偿金以及接受劳动行政部门的行政处罚等。
追究方式：
- 劳动者可通过与单位协商、向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁等方式追究单位的法律责任。
证据收集：
- 在追究单位责任时，劳动者应收集相关证据，如考勤记录、工资单、劳动合同等，以证明单位的行为违法。
四、建议与总结
了解工时制度：
- 劳动者应了解自己所在单位的工时制度，以及在休息日工作的权益。
审查合同与制度：
- 仔细审查劳动合同和单位规章制度，确保自身权益不受侵害。
及时维权：
- 若认为单位行为违法，应及时采取措施维权，如与单位协商、投诉或申请劳动仲裁等。
总结：单位在休息日仅发放日工资是否违法，需根据单位的工时制度以及是否安排补休等因素进行综合判断。若构成违法，劳动者有权要求单位承担相应的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。