机关事业单位安排36小时值班是否合法，需结合具体法律规定及实际情况综合判断，但通常情况下，若未依法保障劳动者权益，则可能不合法。以下从不同角度进行分析：

一、从工作时间与休息休假权利的角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利。对于标准工时制，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周不超过44小时。虽然机关事业单位可能不适用标准工时制，但任何延长工作时间或安排值班的制度，都应当遵循保障劳动者健康、不损害劳动者权益的原则，并依法支付加班工资或安排补休。

若36小时值班制度导致劳动者连续工作时间过长，且未依法安排补休或支付加班工资，则可能违反法律规定。例如，如果值班期间劳动者需要保持高度警觉，无法有效休息，那么这种长时间的连续值班就可能对劳动者的身心健康造成损害。

二、从值班制度合法性的角度

机关事业单位的值班制度通常有其特殊性，可能涉及公共安全、应急响应等方面。然而，这并不意味着可以无视劳动者的权益。值班制度的制定应当遵循合法、合理、公平的原则，并充分考虑劳动者的实际情况和承受能力。

• 合法性：值班制度应当符合国家法律法规的规定，不得与上位法相抵触。
• 合理性：值班时间、频率、强度等应当合理，不得过度剥夺劳动者的休息时间。
• 公平性：值班制度的实施应当公平对待所有劳动者，避免出现不合理的差别对待。

三、从实际操作与证据收集的角度

在实际操作中，如果劳动者对36小时值班制度有异议，可以采取以下措施：

1. 与单位协商：首先尝试与单位进行沟通，表达自己的关切和诉求，寻求合理的解决方案。
2. 收集证据：保留与值班相关的证据，如值班表、加班记录、工资单等，以备不时之需。
3. 寻求法律援助：如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的权益。

四、特殊情况下的考虑

在某些特殊情况下，如紧急事件、自然灾害等，机关事业单位可能需要安排劳动者进行长时间的连续值班。这种情况下，虽然可能超出常规的工作时间限制，但应当依法给予劳动者相应的补偿和保障，如支付高额的加班工资、安排补休等。

建议：

• 对于机关事业单位而言，应当制定合法、合理、公平的值班制度，并充分考虑劳动者的实际情况和承受能力。
• 对于劳动者而言，如果对值班制度有异议，应当及时与单位沟通并寻求解决方案。如果无法达成一致，可以通过法律途径维护自己的权益。

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