在诉讼处理中，法官对于发包方擅自使用未经验收的建设工程的质量问题鉴定，通常会从以下几个方面进行认定：
发包方擅自使用的法律后果：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用后，又以使用部分质量不符合约定为由主张权利的，不予支持。这意味着，一旦发包方擅自使用了未经验收的工程，就视为其接受了工程当前的质量状态，后续再以质量问题为由提出异议，法院可能不予支持。
质量问题鉴定的启动条件：
- 在发包方擅自使用未经验收工程的情况下，若要启动质量问题鉴定，通常需要满足一定的条件。例如，如果发包方能提供初步证据证明工程存在重大质量问题，且该问题并非由其擅自使用行为导致，法院可能会考虑启动鉴定程序。但这一过程较为严格，因为发包方擅自使用行为本身就承担了相应的风险。
鉴定内容的限定：
- 即使启动了质量问题鉴定，鉴定内容也通常限于与发包方擅自使用行为无直接关联的部分。例如，如果工程的基础结构或主体结构存在质量问题，且这些问题在发包方使用前就已存在，那么这部分质量问题可能会被纳入鉴定范围。但如果是由于发包方使用不当或后续改造导致的质量问题，则通常不会被鉴定。
举证责任的分配：
- 在此类案件中，举证责任的分配至关重要。发包方需要承担证明工程存在质量问题的初步举证责任。如果发包方无法提供充分证据，或者其证据被法院认定为不足以证明质量问题，那么法院可能会驳回其鉴定申请或诉讼请求。
法官的自由裁量权：
- 在具体案件中，法官会根据案件事实、证据情况以及相关法律法规，行使自由裁量权。例如，法官可能会考虑发包方擅自使用的程度、工程的质量状况、双方当事人的过错程度等因素，来综合判断是否支持发包方的质量问题鉴定申请或诉讼请求。
法律建议：
- 对于发包方而言，应严格遵守法律法规，不得擅自使用未经验收的建设工程。如果确实需要使用，应与承包方协商并达成书面协议，明确双方的权利义务以及可能产生的法律后果。
- 对于承包方而言，应确保工程质量符合合同约定和相关法律法规的要求。在工程竣工后，应及时向发包方提交竣工验收报告，并督促发包方进行验收。
- 如果双方发生争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决争议。在诉讼过程中，应充分准备证据，明确诉讼请求和事实理由，以便更好地维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果发包方擅自使用未经验收的建设工程，并因此导致质量问题或安全事故，发包方可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于赔偿损失、承担行政责任等。
- 如果承包方交付的工程存在质量问题，且该问题在发包方使用前就已存在，承包方可能需要承担修复、赔偿等法律责任。
如有具体法律问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。