发包方擅自使用工程，承包人以工程未经验收为由拒付分包人工程款的情况下，法院一般会判决发包方支付工程款。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第799条规定，建设工程竣工后，发包人应当根据施工图纸及说明书、国家颁布的施工验收规范和质量检验标准及时验收。验收合格的，发包人应当按照约定支付价款，并接收该建设工程。
   • 《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》第九条明确，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用的，以转移占有建设工程之日为竣工日期。

2. 案例支持：

   • 在实际案例中，如发包方在未经竣工验收的情况下擅自使用工程，并以此为由拒付工程款，法院通常不予支持。例如，某置业公司在工程完工并投入使用后，以工程未经验收为由拒付剩余工程款，法院最终判决其支付工程款及利息。

3. 法律后果：

   • 如发包方擅自使用未经验收的工程，并拒绝支付工程款，不仅可能面临法院的判决支付义务，还可能承担因此产生的利息、诉讼费用等额外成本。
   • 同时，承包方在合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量仍需承担民事责任，但这并不构成发包方拒付工程款的理由。

综上所述，发包方擅自使用工程并不能成为其拒付工程款的有效理由。在承包方已按合同约定完成工程，并发包方已擅自使用的情况下，法院通常会判决发包方支付工程款。因此，建议发包方在擅自使用工程前，应确保工程已经过竣工验收，以避免不必要的法律纠纷。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。