公司安排休息扣全勤奖是否合法，需根据具体情况及法律法规进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、不合法的情况
放假原因归责于公司：
- 若公司因自身原因（如经营调整、设备检修、业务淡季等）安排员工休息，导致员工未能出勤，此时扣除全勤奖是不合法的。因为全勤奖旨在激励员工在正常工作时间内保持出勤，而公司安排的休息并非员工个人缺勤行为。
- 举例：若公司因订单减少进行设备升级改造，期间安排员工休息，并以员工未出勤为由扣除全勤奖，则侵犯了员工的合法权益。
违反劳动合同或规章制度：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定，在公司安排休息的情况下不影响全勤奖的发放，公司擅自扣除则违反了合同约定或规章制度，属于不合法行为。
- 举例：若劳动合同中写明“因公司原因安排员工休息的，不影响员工当月全勤奖的获得”，公司在因场地装修安排员工休息后扣除全勤奖，即违背了合同约定。
未提前告知或未经民主程序：
- 若公司规章制度中关于扣除全勤奖的规定未通过民主程序制定，或未向员工进行公示、告知，员工在不知情的情况下被扣除全勤奖，也是不合法的。
二、合法的情况（存在争议，需谨慎判断）
- 公司规定合理且公示：
- 理论上，若公司的规章制度中明确规定了全勤奖的评定标准，包括在公司安排休息的情况下也扣除全勤奖，并且该规章制度是通过民主程序制定，已向员工进行了公示或告知，那么公司扣除全勤奖可能会被认定为合法。
- 但需注意：此类规定在实践中可能存在较大争议，因其可能不合理地加重了员工的负担。公司需证明规章制度的合理性和合法性，例如，对于业务性质特殊、对员工出勤连贯性要求极高的公司，即使公司安排休息也会对整体业务产生较大影响。若公司在制定规章制度时充分考虑了员工权益并进行了公示，这种情况下扣除全勤奖可能具有一定的合理性，但也需接受法律的严格审查。
三、员工维权途径
- 如果员工认为公司扣除全勤奖的行为不合法，首先应与公司进行沟通协商，要求补发全勤奖。
- 若协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工应提供相关证据，如劳动合同、公司规章制度、休息通知、工资条等，以证明自己的主张。
四、总结与建议
公司在制定相关规章制度时，应确保内容的合理性和合法性，并充分保障员工的知情权。对于全勤奖的评定标准，公司应明确、具体，并经过民主程序制定和公示。员工在面临权益受损时，也应积极通过合法途径维护自己的权益。
建议：作为员工，在入职时应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解全勤奖的评定标准和扣除条件。若对公司规定有疑问或不满，应及时与公司沟通或寻求法律帮助。同时，保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。
再次强调：公司安排休息扣全勤奖的合法性并非绝对，需结合具体情况和法律法规进行综合判断。若您对此有疑问或遭遇了相关纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。