公司员工被拘留后，工资是否发放需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、行政拘留情况
工资停发：
- 根据原劳动部《关于贯彻执行<中华人民共和国劳动法>若干问题的意见》(劳部发〔1995〕309号)第28条规定，若员工因违法行为被行政拘留，在其被拘留期间，用人单位有权暂停劳动合同的履行，不支付工资报酬。这是因为员工的违法拘留行为可能影响正常工作秩序及劳动合同履行。
错误拘留的补偿：
- 如果事后被证明是错误拘留的，员工的损失可由其依据《国家赔偿法》要求有关部门赔偿，而非由用人单位承担工资支付责任。
二、刑事拘留情况
无罪判定：
- 若员工最终被判定无罪，根据相关规定，用人单位应按照劳动合同约定支付其被拘留期间的工资。这是因为员工在无罪的情况下，其被拘留期间的权益应得到保障。
有罪判定：
- 若员工最终被判定有罪，从法律角度，用人单位可以解除劳动合同并不支付工资。这是因为员工的有罪行为可能违反了公司的规章制度或劳动合同的约定，导致劳动合同无法继续履行。
三、地方司法实践差异
- 各地在司法实践中可能存在差异。有些地方会考虑劳动者在拘留期间可能无法正常工作等因素，支持用人单位根据实际情况适当调整工资支付比例。因此，在处理此类问题时，还需结合当地的司法实践进行判断。
四、法律建议与风险防范
保留证据：
- 用人单位在处理员工被拘留期间的工资问题时，应注意保留相关证据，如拘留通知书等，以备不时之需。这有助于在发生劳动争议时，证明用人单位的处理行为是合法合理的。
协商与沟通：
- 在处理此类问题时，用人单位应与员工进行充分的协商与沟通，了解员工的实际情况和需求，尽量达成双方都能接受的解决方案。这有助于维护良好的劳动关系，避免不必要的劳动争议。
遵循法律法规：
- 用人单位在处理员工被拘留期间的工资问题时，必须严格遵循相关的法律法规和政策规定，确保处理行为的合法性和合理性。否则，可能面临劳动争议仲裁或诉讼的风险，给用人单位带来不必要的经济损失和声誉损害。
总结来看，公司员工被拘留后工资是否发放需根据拘留类型（行政拘留或刑事拘留）、最终判定结果以及地方司法实践等多方面因素进行综合考虑。如果您或您的公司遇到此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更准确的法律建议。