公司若存在员工长期超时上班的情况，为规避风险，可采取以下措施：

1. 合法合规安排加班：

   • 公司应严格遵守《劳动法》及相关规定，确保员工每周工作时间不超过法定标准，即每日不超过8小时，平均每周不超过44小时。若需加班，应与员工协商一致，并确保每月加班时间不超过36小时。
   • 加班应支付加班费，具体标准为：工作日加班不低于工资的150%，休息日加班且未安排补休的不低于工资的200%，法定节假日加班不低于工资的300%。

2. 推行计件工薪制或综合工时制：

   • 计件工薪制：对于适合计件的工作岗位，公司可以推行计件工薪制，以员工个人劳动产量获取报酬。但需注意，计件工薪制需向劳动管理部门报备，并确保计件单价合理，不违反最低工资标准。
   • 综合工时制：对于因生产特点不能实行标准工时制的岗位，公司可以尝试申请综合工时制。综合工时制需向劳动监管部门报批，并确保在综合计算周期内，员工的总工作时间不超过法定标准。

3. 完善工会架构与劳资管理制度：

   • 公司应完善工会架构，强化工会职能，确保工会能够代表员工利益，与员工协商加班等事宜。
   • 建立健全劳资管理制度，明确加班的标准、程序及补偿机制，通过制度来规范加班行为，减少纠纷。

4. 优化加班工时报酬及激励措施：

   • 公司应优化加班工时报酬，确保加班费按时足额发放，提高员工对加班的接受度。
   • 同时，可以设立加班激励措施，如提供加班餐、交通补贴等，以缓解员工因超时加班产生的压力情绪和抱怨氛围。

5. 加强内部安全文明生产和培训：

   • 公司应加强内部安全文明生产培训，提高员工的安全意识和操作技能，减少因操作不当导致的工伤事故。
   • 完善工伤、意外保险和企业雇主责任风险的转接，确保在发生工伤事故时，员工能够得到及时有效的救治和赔偿。

6. 提升员工单位工时内的劳动效率：

   • 公司应促成一线人员技能培训培养机制，通过培训提升员工的技能水平和工作效率，从而在单位工时内完成更多的工作量，减少加班需求。

7. 设立专职劳动关系管理人员：

   • 人力部门应设立专门的劳动关系管理人员，负责跟进加班的协调与异常处理，确保加班行为符合法律法规和公司制度。

风险警示：

• 若公司长期超时安排员工上班且未采取有效措施规避风险，可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
• 员工也可能因此提起劳动仲裁或诉讼，要求公司支付加班费、经济补偿金等，甚至可能要求解除劳动合同并主张赔偿金。

建议：

• 公司应正视超时加班的隐患，权衡利弊，采取有效、可行、人性的措施应对。若无法有效规避风险，建议老老实实执行法律法规政策，不要侥幸规避。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见。