如果你已经请假但被公司算作旷工，这是不合理的，你可以通过以下步骤来维护自己的合法权益：
一、明确请假类型与流程
病假情况：
- 如果你因病请假，应确保已按照公司规定提供了正规医院的诊断证明、病历、病假条等相关材料。
- 若公司仍以旷工论处，此行为可能违法，因为劳动者有就医及休息恢复健康的权利。
其他假别（如事假）：
- 查看公司规章制度，确认请假流程及批准条件。
- 若你未按规定流程请假，公司按旷工处理可能具有一定合理性；但如果公司规章制度本身不合理或未经民主程序制定并公示，其以此认定旷工可能不被法律认可。
二、收集证据
- 请假申请记录：如纸质请假条、电子邮件请假记录、办公软件上的请假申请截图等。
- 批准记录：领导通过邮件、即时通讯工具（如微信、钉钉等）批准请假的聊天记录或批复文件。
- 其他辅助证据：如因病请假时的医院诊断证明、病历、缴费凭证；因紧急事项请假时的相关事件证明，如交通事故认定书、亲属关系证明等。
三、与公司沟通协商
- 选择合适的沟通对象：优先与直接上级领导沟通，了解为何会出现将请假误判为旷工的情况，并要求单位纠正错误。若上级无法解决问题，再向人力资源部门反映。
- 注意沟通方式和态度：保持平和、理性的态度，出示证据，明确要求单位纠正错误的旷工认定，并恢复你的正常考勤记录。
四、向劳动监察部门投诉
- 准备投诉材料：包括本人身份证复印件、劳动合同、请假相关证据、工资条等能证明劳动关系和权益受损的材料。
- 提交投诉：可通过线上或线下的方式向劳动监察部门提交投诉申请。劳动监察部门会对情况进行调查核实，并根据调查结果依法对单位进行处理。
五、申请劳动仲裁
- 提交仲裁申请：若对劳动监察部门的处理结果不满意，或单位仍然拒绝纠正错误，你可向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。撰写劳动仲裁申请书，详细说明诉求（如恢复考勤记录、支付旷工期间扣除的工资、赔偿相应损失等）、事实和理由，并附上之前收集的证据材料。
- 参加仲裁庭审：劳动仲裁委员会受理申请后，会安排开庭审理。在庭审中，你需进一步阐述观点，提供证据支持主张。仲裁庭会根据双方提供的证据和陈述进行裁决。
六、提起诉讼
- 若对劳动仲裁结果不服：你可在规定的期限内向人民法院提起诉讼。由人民法院对案件进行审理和判决。法院的判决具有最终的法律效力，若单位不执行判决，你可申请强制执行。
总结与建议：面对请假被当作旷工处理的不合理情况，你应保持冷静并主动采取措施维护自己的合法权益。从明确请假类型与流程开始，到收集证据、与公司沟通协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁以及提起诉讼，每一步都至关重要。确保你了解自己的权益和公司的规定，并采取适当的措施来维护自己的合法权益。如果你在这个过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。