结论：公司借调员工被借方辞退后，员工起诉借方是否合理，需根据具体情况判断，包括辞退原因、劳动合同签订主体、借调协议内容等因素。
一、从劳动合同签订主体角度分析
若劳动合同是与借出方签订：
- 员工与借出方存在劳动关系，借调期间，员工虽在借方工作，但劳动关系并未转移。
- 若借方辞退员工，且辞退原因不符合法律规定（如无合法理由、未遵循法定程序等），员工有权向借出方或借方主张权利，具体取决于辞退行为的实施主体及责任承担约定。
- 若起诉借方合理的情况：若借方未经借出方同意，擅自辞退员工，且该辞退行为违法，员工可以借方为被告提起诉讼，要求借方承担违法辞退的法律责任，如支付赔偿金等。
- 若起诉借方可能不合理的情况：若借调协议中明确约定，借调期间员工的辞退由借出方负责，或借方辞退行为是基于借出方的指示，则员工起诉借方可能面临主体不适格的问题。
若劳动合同是与借方签订：
- 员工与借方直接建立劳动关系，借调行为实质上为内部工作安排。
- 若借方辞退员工，且辞退行为违法，员工当然有权起诉借方，要求其承担违法辞退的法律责任。
二、从辞退原因角度分析
合法辞退：
- 若借方辞退员工是基于合法理由（如员工严重违反公司规章制度、不能胜任工作等），且遵循了法定程序（如提前通知、支付经济补偿等），则员工起诉借方可能缺乏法律依据。
违法辞退：
- 若借方辞退员工无合法理由，或未遵循法定程序，则构成违法辞退。
- 在此情况下，员工有权起诉借方，要求其承担违法辞退的法律责任，包括但不限于支付赔偿金、恢复劳动关系等。
三、从借调协议内容角度分析
- 借调协议是明确借出方、借方和员工三方权利义务的重要文件。
- 若借调协议中明确约定了辞退员工的条件、程序及责任承担方式，则应按照协议约定处理。
- 若协议约定借方有权辞退并承担责任：则员工起诉借方合理。
- 若协议约定辞退需经借出方同意或由借出方负责：则员工直接起诉借方可能面临障碍，需根据协议约定及实际情况确定责任主体。
法律建议
- 审查劳动合同：首先确认劳动合同是与借出方还是借方签订，以明确劳动关系主体。
- 审查辞退行为：分析辞退原因是否合法，程序是否合规。
- 审查借调协议：查看借调协议中关于辞退员工的约定，以确定责任承担方式。
- 咨询专业律师：在面临复杂情况时，建议咨询专业律师，以便更准确地判断起诉借方的合理性及制定应对策略。
举例：假设员工与借出方签订劳动合同，后被借调至借方工作。借方因员工轻微违纪（如迟到几次）便将其辞退，且未支付经济补偿。在此情况下，若借调协议未约定辞退由借出方负责，或虽约定但借方未遵循协议程序，则员工起诉借方要求支付赔偿金是合理的。
如有具体案情或疑问，欢迎直接向我咨询。