针对您提出的“户口是非农业但是在农村居住有一套合法确权的房屋可以翻建吗”这一问题，我将结合相关法律法规和政策，为您进行详细解答。

首先，我们需要明确的是，无论您的户口性质如何（农业或非农业），只要您在农村拥有一套合法确权的房屋，即该房屋已经取得了不动产登记权属证书或集体建设用地使用权，那么您在原则上是有权对该房屋进行翻建的。但这里有几个关键点需要注意：

1. 合法审批：根据《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国城乡规划法》的规定，农村村民建房（包括翻建）需要取得宅基地批准书和乡村建设规划许可证。这是翻建房屋的前提条件，未经批准擅自翻建可能被视为违法建筑。

2. 符合规划：翻建房屋必须符合乡镇土地利用总体规划和村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。如果当地土地规划已经发生变化，且您的翻建计划不符合新规划，那么您将无法获得翻建许可。

3. 宅基地面积标准：宅基地面积不能超过省、自治区、直辖市的规定标准。如果您的房屋建于较早时期，且按当时标准合法，但按现在标准可能超过了面积限制，那么在翻建时需要按照当前标准进行调整。

4. 非本集体成员继承房屋的特殊情况：虽然您的情况并不直接涉及继承问题，但值得注意的是，如果房屋是由非本集体成员继承的，且继承人不符合宅基地申请条件，那么该房屋不得翻建、改建、扩建。不过，这一规定并不适用于您的情况，因为您已经拥有合法确权的房屋。

5. 其他限制条件：除了上述几点外，还有一些其他限制条件需要注意，如房屋所有权存在争议、改变土地用途等。这些情况都可能导致您无法获得翻建许可。

具体操作建议：

• 在决定翻建房屋前，建议您先向当地乡镇政府或国土资源部门咨询相关政策和审批流程。
• 准备好相关证明材料，如不动产登记权属证书、集体建设用地使用权证等。
• 按照审批要求提交翻建申请，并等待相关部门进行现场勘查和审批。
• 在获得翻建许可后，按照审批结果进行翻建，并确保施工过程中的安全和合规性。

综上所述，只要您满足合法审批、符合规划、宅基地面积标准等条件，且房屋所有权无争议、未改变土地用途等，那么您作为非农业户口但在农村拥有合法确权房屋的居民，是有权对该房屋进行翻建的。但请务必遵循相关法律法规和政策要求，确保翻建过程的合法性和合规性。