劳动仲裁期间公司股东退出是否合法，需根据具体情况判断，结论前置如下：
- 若股东退出符合公司章程、股东协议及法定程序，且无恶意逃避责任情形，则合法；
- 若股东退出违反公司章程、股东协议或法定程序，或存在恶意逃避责任情形，则可能被认定为不合法。
一、合法性判断依据
公司章程及股东协议：
- 股东的退出行为首先需遵循公司章程和股东协议的约定。若章程或协议中未对劳动仲裁期间的股东退出做出明确限制，则股东可按照法定程序进行退出。
- 例如，若公司章程规定“股东在劳动仲裁期间不得转让股权”，则股东在此期间的退出行为将可能被视为违反约定，从而影响其合法性。
法定程序：
- 股东退出必须严格遵守《公司法》及相关法律法规规定的程序。如股权转让需经其他股东过半数同意，并办理股权变更登记手续等。
- 只有按照法定程序进行的退出才是合法的。若股东未履行法定程序，如未经其他股东同意擅自转让股权，则可能被认定为不合法。
二、可能影响合法性的因素
特别约定与限制：
- 如果公司章程或股东协议中包含特定情形下的退出限制，如在劳动仲裁期间禁止股权转让，那么股东在此期间的退出行为将可能被视为违反约定。
- 这种情况下，股东的退出行为可能因违反公司章程或股东协议而被认定为不合法。
恶意逃避责任：
- 股东若以逃避劳动仲裁可能带来的法律责任为目的进行退出，如低价转让股权给无偿还能力的第三方，将可能被认定为恶意逃避债务。
- 此行为不仅损害劳动者合法权益，也将面临法律追究。例如，股东在劳动仲裁期间将股权转让给无偿还能力的第三方，导致公司无法履行对劳动者的赔偿义务，这种行为将被视为恶意逃避责任。
三、劳动仲裁与公司股东退出的关系
独立性与间接影响：
- 劳动仲裁主要解决劳动者与用人单位之间的争议，而股东退出则是公司内部事务。两者虽为独立法律关系，但股东的退出可能间接影响公司的财务状况和运营能力，进而对劳动仲裁的结果产生一定影响。
- 例如，若股东退出导致公司资金链断裂，无法支付劳动者的赔偿金，则可能影响劳动仲裁的结果。
劳动者权益保护：
- 无论股东是否退出，劳动者的合法权益均受法律保护。若劳动者认为股东的退出行为损害了其权益，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径寻求救济。
- 劳动者可以依法向劳动仲裁部门或法院提起申诉，要求股东或公司承担相应的法律责任。
四、实际操作建议
审查公司章程及股东协议：
- 在劳动仲裁期间，股东若考虑退出，应首先审查公司章程及股东协议，确保退出行为不违反相关约定。
遵循法定程序：
- 股东退出应严格遵循《公司法》及相关法律法规规定的程序，确保退出行为的合法性。
避免恶意逃避责任：
- 股东应避免以逃避法律责任为目的进行退出，如低价转让股权给无偿还能力的第三方等行为。
与劳动者沟通：
- 股东退出过程中，公司应积极与劳动者沟通，确保劳动者的合法权益得到妥善处理，避免引发不必要的纠纷。
总结来说，劳动仲裁期间公司股东退出的合法性是一个复杂的问题，需要综合考虑公司章程、股东协议、法定程序以及退出行为对劳动仲裁结果和劳动者权益的潜在影响。在确保遵守法律法规和公司规定的前提下，股东应谨慎行事，以避免损害劳动者权益和引发法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。