用人单位发现员工提供假冒证明时，可依法采取以下处理措施：

1. 调查核实与证据固定
   用人单位应首先通过内部核查（如联系证明出具方、比对公章真伪等）确认证明材料的虚假性。若涉及第三方机构（如学校、医院），可要求其出具书面说明或通过公证程序固定证据。此阶段需注意保留原始证明文件、沟通记录等证据，避免因证据不足导致后续处理被动。

2. 依据规章制度处理
   若员工行为违反公司《员工手册》或相关制度中关于“诚信”或“提供虚假材料”的条款，用人单位可依据制度规定给予警告、记过、降职或解除劳动合同等处分。关键点：制度需经民主程序制定并公示，否则可能被认定为无效。例如，某公司因未公示“提供虚假证明可解雇”的条款，最终被判违法解除。

3. 解除劳动合同的合法性审查
   根据《劳动合同法》第三十九条，员工“以欺诈手段使单位在违背真实意思的情况下订立或变更劳动合同”的，用人单位可解除合同且无需支付补偿。但需满足：

   • 员工主观故意（如明知证明虚假仍提交）；
     
   • 证明内容与劳动合同履行直接相关（如学历造假影响岗位胜任）；
     
   • 解除程序合法（提前通知工会、送达解除通知等）。
     案例参考：某员工伪造工作经验证明入职，法院认定其行为构成欺诈，支持公司解雇决定。

4. 追偿损失与法律责任
   若员工行为给公司造成经济损失（如因资质造假导致项目违约），用人单位可依据《工资支付暂行规定》第十六条要求其赔偿。赔偿金额通常以实际损失为限，且需证明损失与员工行为存在直接因果关系。

5. 行政与刑事责任提示
   若假冒证明涉及伪造国家机关公文、证件（如伪造毕业证），用人单位可向公安机关报案，员工可能面临《治安管理处罚法》第五十二条的罚款或拘留，情节严重者构成《刑法》第二百八十条的伪造证件罪，最高可处七年有期徒刑。

建议行动步骤：

1. 立即暂停员工工作，避免损失扩大；
   
2. 书面要求员工说明情况并提交真实证明；
   
3. 依据制度作出处分决定，并留存送达证据；
   
4. 必要时委托律师介入，确保处理程序合法。
   

如有具体案例或制度条款需要进一步分析，可直接向我提问。