在合同纠纷背景下，用人单位能否代发外包员工工资需分情况讨论：

1. 常规情况：外包公司为工资发放主体

根据劳动法及外包协议的通常约定，外包员工与外包公司存在劳动关系，工资应由外包公司直接发放。这是因为：

• 法律义务：外包公司作为用人单位，需按照劳动合同约定和国家规定，及时足额支付劳动报酬（《劳动合同法》第30条）。
• 风险隔离：若由用人单位代发，可能因工资计算标准、发放时间等争议，导致外包公司与用人单位互相推诿责任。

示例：
小张与A外包公司签订劳动合同，被派遣至B公司工作。根据协议，A公司每月10日发放工资。若B公司未经小张同意，擅自代发工资并降低标准，小张有权要求A公司补足差额，并可追究B公司干扰劳动关系的责任。

2. 特殊约定：用人单位代发的合法性及风险

若用人单位与外包公司明确约定代发工资，且员工知晓并同意，则代发行为合法。但需满足以下条件：

• 协议明确：代发条款需写入外包合同，明确工资标准、发放时间、责任划分等。
• 员工知情：需通过书面形式（如补充协议）告知员工，并取得其签字确认。
• 合规操作：用人单位需按约定标准发放，不得克扣或拖延。

风险点：

• 法律纠纷：若代发导致工资计算错误、发放延迟，员工可能同时起诉外包公司和用人单位。
• 劳动关系混淆：代发可能被认定为“事实劳动关系”，导致用人单位承担额外责任（如社保、经济补偿等）。

示例：
C公司与D外包公司约定，由C公司代发外包员工工资，并签订补充协议告知员工。后因C公司财务问题拖欠工资，员工可同时要求D公司（劳动关系主体）和C公司（代发方）承担连带责任。

3. 纠纷处理：员工如何维权？

若因代发工资引发争议，员工可按以下步骤维权：

1. 向外包公司主张权利：
   首先要求外包公司履行支付义务，因其是劳动关系主体。
2. 追究用人单位责任：
   若代发协议导致工资发放混乱，员工可通过劳动仲裁，要求外包公司和用人单位承担连带责任（《劳动合同法》第92条）。
3. 证据收集：
   保留劳动合同、工资条、代发协议、沟通记录等证据，证明工资发放主体及金额争议。

4. 法律建议

• 对用人单位：
  避免擅自代发工资，若需代发，务必与外包公司签订书面协议，并取得员工同意。同时，建立内部审核机制，确保工资发放合规。
• 对外包公司：
  在协议中明确工资发放主体，若委托用人单位代发，需监督其履行义务，避免因代发问题承担连带责任。
• 对员工：
  签订劳动合同时，仔细阅读工资发放条款。若发现工资异常，及时与外包公司沟通，并保留维权证据。

结论：
用人单位能否代发外包员工工资，取决于协议约定和员工同意。若无明确约定或员工不知情，代发行为可能违法，员工有权要求外包公司承担责任，并可追究用人单位的连带责任。建议各方在合同中明确权利义务，避免纠纷。如有具体案件，可进一步向我咨询细节。