结论前置：用人单位或中介以未领取工作鞋为由扣减工资的行为缺乏法律依据，您有权拒绝并要求足额支付工资。以下是具体分析：
1. 法律对工资扣减的严格限制
根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位仅能在以下两种情形下扣减工资：
- 因劳动者个人原因造成经济损失（如故意损坏设备），且每月扣减不得超过当月工资的20%；
- 经劳动者本人书面同意的代扣事项（如社保、个人所得税等）。
未领取工作鞋既不属于劳动者过错导致的经济损失，也未涉及劳动者书面同意的代扣事项，因此中介或用人单位无权以此为由扣减工资。
2. 工作鞋的性质与费用承担
- 若工作鞋属于劳动保护用品（如防砸鞋、绝缘鞋等）：根据《安全生产法》第四十五条，用人单位必须免费提供，不得要求劳动者承担费用。
- 若工作鞋属于普通工装：即使合同约定“离职需归还”，未领取也不构成劳动者违约，用人单位只能要求返还实物，而非折价扣款。
3. 中介扣款的合法性存疑
若您通过中介入职，需区分责任主体：
- 中介仅为居间方：无权直接扣减工资，其行为可能涉嫌违法。
- 中介为用人单位：需承担用人单位责任，但扣款理由仍不成立。
4. 维权建议
- 收集证据：保留劳动合同、工资条、离职证明、中介扣款通知等书面材料。
- 协商解决：向用人单位或中介书面提出异议，要求限期改正。
- 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉（电话：12333），或申请劳动仲裁（免费）。
- 法律途径：若争议金额较大，可委托律师向法院起诉，主张足额支付工资及赔偿金。
提示：用人单位常以“规章制度”为由扣款，但此类规定若未经过民主程序（如职工代表大会讨论）或未公示，则对劳动者无效。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。