便利店三天没有工资霸王条款是违法的。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 霸王条款的定性

1. 定义：霸王条款通常指的是在合同中，一方利用自身优势地位，强迫另一方接受的不公平、不合理的条款。这些条款往往剥夺或限制了弱势一方的合法权益。
2. 法律规制：《民法典》及《合同法》等相关法律法规均对霸王条款进行了规制，强调合同应当遵循公平、自愿、等价有偿、诚实信用等原则。

二. 便利店三天没有工资条款的违法性分析

1. 工资支付义务：根据《劳动法》及《劳动合同法》的相关规定，用人单位有义务按时足额支付劳动者的工资。便利店作为用人单位，不能通过合同条款来规避这一法定义务。
2. 条款的无效性：如果便利店在劳动合同中设置了“三天没有工资”的条款，且该条款明显违反了法律法规关于工资支付的规定，那么这一条款将被视为无效。

三. 劳动者的权益保护

1. 维权途径：劳动者在面对霸王条款时，可以依法向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
2. 赔偿责任：如果便利店因霸王条款给劳动者造成了损失，便利店还应当承担相应的赔偿责任。

综上所述，便利店在劳动合同中设置“三天没有工资”的霸王条款是违法的。我建议劳动者在遇到此类情况时，应勇敢站出来维护自己的合法权益，必要时可以寻求法律援助或提起诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。