您已还清车款但信用贷款未还清，公司不给车辆抵押的大本（即机动车登记证书），您有权要求公司返还。以下是对此问题的详细分析：

一. 车辆抵押与信用贷款的关系

1. 车辆抵押：根据《中华人民共和国民法典》第三百九十五条，交通运输工具（包括车辆）可以作为抵押财产。在您通过金融机构办理车款时，可能已将车辆作为抵押物。
2. 信用贷款与抵押物的关系：信用贷款通常是以您的信用为基础发放的贷款，不一定与车辆抵押直接相关。即使您通过同一金融机构办理了车款和信用贷款，两者在法律上也是独立的合同关系。

二. 已还清车款后的权利

1. 车款还清后的解除抵押：当您已还清车款时，根据抵押合同的约定，金融机构应解除车辆抵押，并返还机动车登记证书（大本）。
2. 公司不给大本的处理：若公司已确认您车款已还清，但拒绝返还机动车登记证书，这违反了抵押合同的约定，也侵犯了您的合法权益。

三. 信用贷款未还清不影响大本返还

1. 独立性：如前所述，车款与信用贷款在法律上是独立的合同关系。信用贷款未还清，并不影响您要求金融机构返还已解除抵押的车辆大本。
2. 公司无权扣留：公司不能因您信用贷款未还清而扣留车辆大本。这是两个不同的法律关系，不能混为一谈。

四. 法律建议

• 与公司协商：首先，您可以与公司进行沟通，明确表达您已还清车款并要求返还车辆大本。
• 法律途径：若公司拒绝返还，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。

我的观点：您已还清车款，金融机构应依法解除车辆抵押并返还机动车登记证书。信用贷款未还清并不构成公司拒绝返还大本的理由。如有进一步需要，您可以继续咨询我。