针对您提出的“工伤认定申请中公司未举证怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，根据《工伤保险条例》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病后，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。这是用人单位的法定义务。
然而，在实际操作中，如果用人单位未按规定提出工伤认定申请，或者未在规定时限内提交相关证据材料，您作为工伤职工或者您的近亲属、工会组织，有权在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
针对公司未举证的情况，您可以采取以下措施：
自行申请工伤认定：
- 您需要准备相关的工伤认定申请材料，包括但不限于工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书等。
- 提交申请后，社会保险行政部门将依法进行调查核实，并作出工伤认定决定。
要求用人单位承担责任：
- 根据《工伤保险条例》第十七条第四款的规定，用人单位未在本条第一款规定的时限内提交工伤认定申请的，在此期间发生符合本条例规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。
- 这意味着，如果用人单位未及时申请工伤认定，导致您在此期间产生的医疗费、护理费、交通费等工伤待遇费用无法由工伤保险基金支付，那么这些费用应由用人单位承担。
寻求法律援助或提起诉讼：
- 如果用人单位拒绝承担相关责任，或者您对工伤认定结论不服，您可以依法申请行政复议，也可以向人民法院提起行政诉讼。
- 在此过程中，您可以寻求专业律师的法律援助，以维护您的合法权益。
额外建议：
- 在处理工伤认定事宜时，建议您保持与用人单位的沟通，尽量通过协商解决问题。
- 如果协商无果，您可以及时向当地劳动监察部门投诉，或者寻求工会组织的帮助。
- 同时，保留好所有与工伤相关的证据材料，如医疗记录、工作证明、事故现场照片等，以备不时之需。
综上所述，如果公司在工伤认定申请中未举证，您有权自行申请工伤认定，并要求用人单位承担在此期间产生的工伤待遇费用。如果用人单位拒绝承担责任，您可以通过法律途径维护自己的合法权益。