单位垫付医药费后，在特定条件下是可以追偿的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律原则与规定
根据《中华人民共和国社会保险法》第四十二条的规定，由于第三人的原因造成工伤，第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。这一规定体现了法律对于医疗费用不重复主张的原则，即劳动者不得因同一伤害事件获得双重赔偿（医疗费用部分）。
二、司法实践中的处理
不当得利纠纷：
- 在司法实践中，如果单位为员工垫付了医疗费用，而员工后续又从第三方（如保险公司或事故责任方）获得了医疗费用的赔偿，那么单位有权以不当得利为由，要求员工返还垫付的医疗费用。
- 例如，在您提供的案例中，张某在上班途中发生交通事故，单位法定代表人吴某为其垫付了医疗费。后来，张某从保险公司获得了赔偿，其中包括医疗费用。吴某遂以不当得利为由，要求张某返还垫付的医疗费用，并得到了法院的支持。
工伤保险与民事损害赔偿的协调：
- 我国法律肯定了受害人对于侵权第三人有独立的民事赔偿请求权，同时也肯定了受害人获得工伤赔偿的权利。但在两者并存的情况下，劳动者的医疗费损失不得重复主张。
- 如果员工已经获得了侵权第三人的赔偿，再请求用人单位依法承担工伤保险待遇时，用人单位承担的工伤保险责任应扣除第三人已支付的医疗费等实际发生的必要费用。
三、单位追偿的条件与程序
条件：
- 单位必须能够证明其为员工垫付了医疗费用。
- 员工必须已经从第三方获得了医疗费用的赔偿。
- 单位与员工之间未就垫付医疗费用的返还达成其他协议。
程序：
- 单位可以与员工协商，要求其返还垫付的医疗费用。
- 如果协商无果，单位可以向法院提起诉讼，要求员工返还垫付的医疗费用。在诉讼过程中，单位需要提供充分的证据证明其垫付了医疗费用，以及员工已经从第三方获得了赔偿。
四、建议与注意事项
保留证据：
- 单位在为员工垫付医疗费用时，应妥善保留相关证据，如医疗费用发票、付款凭证等。
- 这些证据将在后续追偿过程中发挥关键作用。
及时沟通：
- 单位在发现员工已经从第三方获得赔偿后，应及时与员工沟通，要求其返还垫付的医疗费用。
- 避免因拖延时间过长而导致证据丢失或追偿困难。
法律途径：
- 如果协商无果，单位应果断采取法律途径追偿。
- 在诉讼过程中，单位应遵守法律程序，提供充分的证据支持其主张。
举例说明：假设某公司员工小李在上班途中发生交通事故，公司为其垫付了5万元的医疗费用。后来，小李从保险公司获得了6万元的赔偿，其中包括医疗费用。此时，公司有权要求小李返还垫付的5万元医疗费用。如果小李拒绝返还，公司可以向法院提起诉讼，要求小李返还垫付的医疗费用。
总结：单位垫付医药费后，在员工已经从第三方获得医疗费用赔偿的情况下，是有权追偿的。但单位在追偿过程中应遵守法律程序，提供充分的证据支持其主张。如果您或您的单位遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。