结论前置：公司有加班费制度但不让个别员工加班，是否违法需分情况讨论。一般情况下，若公司无正当理由排除个别员工加班，可能涉及违法；但若存在合理理由，则不一定违法。
一、公司无正当理由排除个别员工加班，可能违法
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，所有员工在同等条件下应享有平等的劳动权利，包括加班的权利。如果公司强制要求全体员工加班，却无正当理由将个别员工排除在外，这种行为可能构成对员工的不平等待遇，违反了劳动法的公平原则。
- 具体情形：例如，公司因业务繁忙需要全体员工加班完成某项任务，但突然通知某位员工不需要加班，且未给出合理理由。这种情况下，被排除的员工可能会感到不公平，甚至认为自己的权益受到了侵害。
- 法律后果：如果公司无法提供合理理由来解释为何排除个别员工加班，那么这种行为可能被视为违法。被排除的员工有权要求公司给予合理的解释，并可以通过法律途径维护自己的权益。
二、公司有合理理由排除个别员工加班，不一定违法
当然，也存在一些特殊情况，公司可能有合理的理由排除个别员工加班。例如，员工身体不适、家庭原因无法加班，或者员工的工作性质不适合加班等。
- 具体情形：例如，某位员工近期身体不适，医生建议其避免过度劳累。公司了解到这一情况后，决定不安排该员工加班。这种情况下，公司的行为是合理的，不构成违法。
- 法律后果：由于公司有合理的理由排除个别员工加班，因此这种行为不构成违法。被排除的员工也应理解公司的决定，并积极配合公司的工作安排。
三、劳动者如何维护自己的权益
如果劳动者认为自己被不公平地排除在加班之外，且公司无法提供合理理由，那么劳动者可以采取以下措施来维护自己的权益：
- 与公司协商：首先尝试与公司进行友好协商，要求公司给予合理的解释，并考虑是否可以安排加班。
- 向劳动行政部门投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察大队提交书面投诉材料，详细说明情况，并要求劳动行政部门介入调查。
- 申请劳动仲裁：如果劳动者认为公司的行为严重侵犯了自己的权益，还可以向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，要求公司承担相应的法律责任。
四、建议与提醒
- 了解公司政策：劳动者在入职前应详细了解公司的加班政策，包括加班费的支付标准、加班时间的限制等。
- 保留证据：如果劳动者认为自己被不公平地排除在加班之外，应保留相关证据，如考勤记录、工作任务安排、同事证言等，以便在需要时维护自己的权益。
- 及时沟通：如果劳动者对公司的加班安排有疑问或不满，应及时与公司沟通，寻求解决方案。
总结：公司有加班费制度但不让个别员工加班是否违法，需根据具体情况来判断。如果公司无正当理由排除个别员工加班，可能构成违法；但若存在合理理由，则不一定违法。劳动者在遇到此类情况时，应了解自己的权益，并积极采取措施维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。