结论：超市规定上不满半年就按90元一天算工资的做法，是否合理取决于多个因素，包括劳动合同的具体约定、当地的最低工资标准以及该规定是否违反了相关法律法规的强制性规定。以下是对此问题的详细分析。
一、劳动合同约定优先
劳动合同内容：首先，需要查看您与超市签订的劳动合同中是否明确规定了工作不满半年时的工资计算方式。如果劳动合同中有明确约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么超市按照合同约定支付工资是合法的。
合同变更与协商：如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，超市单方面规定上不满半年就按90元一天算工资，可能涉及合同变更问题。此时，超市应与您进行协商，达成一致意见后方可实施。未经协商一致，超市不得擅自变更劳动合同内容。
二、最低工资标准保障
最低工资规定：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。如果90元一天的工资低于当地最低工资标准，那么超市的规定就是违法的。
地区差异：需要注意的是，不同地区的最低工资标准可能存在差异。因此，在判断超市规定是否合法时，需要参考您所在地区的最低工资标准。
三、法律法规的强制性规定
工资支付规定：根据相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定的时间和方式支付劳动者工资。如果超市的规定违反了法律法规的强制性规定，如未按时足额支付工资、低于最低工资标准等，那么该规定就是无效的。
劳动争议处理：如果您认为超市的规定违反了法律法规或劳动合同约定，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
四、建议与行动
核实劳动合同：建议您首先核实与超市签订的劳动合同内容，查看是否有关于工作不满半年时工资计算方式的明确约定。
了解最低工资标准：查询您所在地区的最低工资标准，判断90元一天的工资是否低于该标准。
与超市协商：如果劳动合同中没有相关约定或约定不明确，您可以与超市进行协商，争取达成更合理的工资计算方式。
寻求法律援助：如果协商无果或超市的规定违反了法律法规，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，必要时也可以咨询我，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
最后，超市规定上不满半年就按90元一天算工资的做法是否合理，需要综合考虑劳动合同约定、最低工资标准以及法律法规的强制性规定。如果您对此有疑问或认为自己的权益受到侵害，请随时向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。