土石方工程第三方鉴定不一定会推翻原始合同，这主要取决于鉴定内容与合同条款的关联性以及鉴定结果对合同履行的影响。以下从不同角度进行分析：

1. 鉴定内容与合同条款的关联性

• 若鉴定内容与合同条款直接相关：例如，合同中明确约定了土石方工程的工程量、质量标准或计价方式，而第三方鉴定结果对上述内容提出了异议或修正，那么鉴定结果可能会对原始合同的履行产生影响。但这种影响并不意味着合同被“推翻”，而是可能引发合同双方对合同条款的重新协商或调整。
• 若鉴定内容与合同条款无直接关联：例如，鉴定的是土石方工程的施工安全、环保措施等方面，而这些方面在合同中并未明确约定或仅作为一般性要求，那么鉴定结果通常不会直接影响原始合同的效力或履行。

2. 鉴定结果对合同履行的影响

• 鉴定结果支持合同履行：如果第三方鉴定结果确认了合同约定的工程量、质量标准或计价方式的合理性，那么这将有助于合同的顺利履行，不会推翻原始合同。
• 鉴定结果引发合同争议：如果鉴定结果与合同约定存在显著差异，可能引发合同双方对合同条款的争议。在这种情况下，双方可能需要通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，但这并不意味着合同被“推翻”，而是合同履行过程中可能出现的正常法律纠纷。

3. 法律原则与合同效力

• 合同自由原则：根据合同法的基本原则，合同双方有权自愿约定合同条款，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同就是有效的。因此，第三方鉴定结果通常不会直接推翻一个合法有效的合同。
• 合同变更与解除：如果因鉴定结果导致合同履行出现重大困难或无法实现合同目的，合同双方可以根据法律规定或合同约定协商变更或解除合同。但这种变更或解除是基于双方协商或法律规定，而非单纯由第三方鉴定结果决定。

4. 实际操作建议

• 在合同中明确约定鉴定条款：为避免因第三方鉴定结果引发的争议，合同双方可以在合同中明确约定鉴定的范围、标准、程序以及鉴定结果对合同履行的影响等条款。
• 及时沟通与协商：如果第三方鉴定结果与合同约定存在差异，合同双方应及时沟通并协商解决方案，以避免争议升级。
• 寻求法律支持：在协商无果的情况下，合同双方可以寻求法律支持，通过诉讼或仲裁等方式解决争议。

总结来看，土石方工程第三方鉴定不一定会推翻原始合同。鉴定结果对合同的影响取决于鉴定内容与合同条款的关联性以及鉴定结果对合同履行的影响。在面对第三方鉴定结果时，合同双方应保持冷静，通过沟通与协商解决问题，并在必要时寻求法律支持。如果您在土石方工程合同方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。