在单位兼职且不知情的情况下，由第三方发放工资，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若单位与第三方存在合法委托关系：

   • 合法性分析：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位有权依法委托第三方代为发放工资，只要这种委托关系是合法、明确且双方（即单位与第三方）均知晓并同意的。在此情况下，即使兼职者不知情，只要工资实际发放且数额无误，该行为并不直接违反法律规定。但单位有义务向兼职者说明工资发放的具体情况，包括发放主体等，以保障兼职者的知情权。
   • 建议：若您发现工资由第三方发放，可向单位询问原因，确认是否存在合法的委托关系。若单位能提供合理说明且工资发放无误，则无需过分担忧。

2. 若单位未告知兼职者且无合法委托关系：

   • 合法性分析：如果单位在未经兼职者同意的情况下，擅自委托第三方发放工资，且这种委托关系并不合法或明确，那么这一行为可能涉嫌侵犯兼职者的合法权益。特别是当第三方发放工资存在延误、错误或未发放等情况时，兼职者的权益将受到直接损害。
   • 法律后果：在此情况下，兼职者有权要求单位立即停止侵权行为，并按照原约定方式发放工资。同时，兼职者还可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
   • 建议：若您发现工资由未经授权的第三方发放，且单位未能给出合理说明，您应及时与单位沟通，要求其按照原约定方式发放工资。若沟通无果，您可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

额外提醒：

• 无论工资由谁发放，兼职者都有权要求单位提供工资单或相关证明，以确认工资的发放情况和数额。
• 兼职者在签订兼职合同时，应明确约定工资的发放方式、时间和数额等关键条款，以避免后续产生纠纷。

总结：在单位兼职且不知情的情况下由第三方发放工资，其合法性取决于单位与第三方之间是否存在合法委托关系以及是否侵犯了兼职者的知情权。若存在合法委托且未侵犯知情权，则行为合法；反之，则可能涉嫌违法。若您遇到此类情况，建议及时与单位沟通并寻求法律帮助。