结论前置：公司在未得到员工同意的情况下随意变更执业药师注册证，一般是不合法的。以下从不同角度进行分析：

1. 从劳动合同角度：

   • 员工与公司签订的劳动合同中，通常会明确员工的工作岗位、职责等内容。执业药师注册证与员工的工作岗位紧密相关，是员工从事特定药学工作的资质证明。
   • 如果公司未经员工同意擅自变更执业药师注册证，可能构成对劳动合同的变更。根据《劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。未经协商一致，公司单方面变更可能违反法律规定，员工有权要求公司恢复原状或承担相应的法律责任。

2. 从执业药师管理角度：

   • 执业药师注册证的变更通常需要遵循一定的程序和规定，包括提交相关材料、经过审核等。这些程序和规定旨在保障执业药师的专业性和资质的真实性。
   • 公司未经员工同意擅自变更执业药师注册证，可能违反了执业药师管理的相关规定，导致注册证无效或被撤销，进而影响员工的职业发展和公司的合规经营。

3. 从员工权益保护角度：

   • 员工有权对自己的执业药师注册证进行管理和保护。未经员工同意，公司不得擅自处置或变更其注册证。
   • 如果公司擅自变更执业药师注册证，员工可以依法维护自己的权益，包括向相关部门投诉、要求公司承担赔偿责任等。

建议：如果公司未经您同意擅自变更了您的执业药师注册证，您可以先与公司进行沟通协商，要求其恢复原状或给出合理的解释和补偿。如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门或执业药师注册管理机构投诉，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。如果您还有其他与法律相关的问题，可以直接向我咨询。