结论：薪资中设置保密费用，员工违规后是否可以追回，需视具体情况及保密协议的约定而定。
一、保密费用的性质与目的
保密费用，通常是企业为了保护其商业秘密、技术秘密或其他敏感信息，而与员工约定的一种经济补偿。这种费用的支付，旨在激励员工遵守保密义务，防止信息泄露给企业带来损失。
二、员工违规后的法律后果
违约责任：
- 如果员工在保密协议中明确承诺了保密义务，并接受了保密费用，但随后违反了保密协议，那么员工就构成了违约。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违约方应当承担违约责任，包括赔偿守约方因此遭受的损失。
追回保密费用的可能性：
- 协议约定：如果保密协议中明确约定了员工违规后，企业有权追回已支付的保密费用，那么企业可以依据协议约定进行追回。
- 无明确约定：如果保密协议中没有明确约定追回条款，企业追回保密费用的难度会增大。此时，企业可能需要通过法律途径，如提起诉讼，来主张员工因违约而应承担的赔偿责任，但这并不直接等同于追回保密费用。
三、实际操作中的考虑因素
证据收集：
- 企业要追回保密费用，首先需要收集员工违规的证据，如泄露信息的记录、证人证言等。
- 证据的充分性和合法性将直接影响企业追回保密费用的成功率。
协议条款的合理性：
- 保密协议中的条款应当合理、明确，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果协议条款存在歧义或不合理之处，可能会影响企业追回保密费用的主张。
法律程序与成本：
- 追回保密费用可能需要通过法律程序进行，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 企业需要考虑法律程序的时间成本、经济成本以及可能面临的风险。
四、建议与措施
完善保密协议：
- 企业在与员工签订保密协议时，应明确约定保密义务、保密费用、违约责任以及追回条款等内容。
- 协议条款应具体、明确，且符合法律法规的规定。
加强员工培训：
- 企业应定期对员工进行保密培训，提高员工的保密意识和法律意识。
- 通过培训，让员工了解保密协议的重要性以及违反协议的后果。
及时采取措施：
- 一旦发现员工违规，企业应及时采取措施，如收集证据、与员工沟通、提起诉讼等。
- 及时采取措施有助于企业更好地维护自身权益。
总结：薪资中设置保密费用后，员工违规是否可以追回需视具体情况及保密协议的约定而定。企业应完善保密协议、加强员工培训，并在发现员工违规时及时采取措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。