针对您提出的“公司申请再次鉴定员工需要配合吗”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《工伤保险条例》的相关规定，当公司对员工的首次劳动能力鉴定结论存在异议时，是有权利在规定时限内（通常是签收鉴定结论后十五日内）向上一级劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请的。这是公司为了保障自身权益，确保工伤赔偿的公正性和合理性而采取的合法措施。

接下来，关于员工是否需要配合的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 法律义务：

   • 根据《工伤保险条例》的规定，对于在规定时限内提出的重新鉴定申请，工伤职工（即员工）是有义务配合的。这是因为再次鉴定是确保工伤认定和赔偿公正性的重要环节，员工作为工伤事件的直接相关方，有责任提供必要的协助和配合。

2. 配合的必要性：

   • 员工配合再次鉴定不仅是对公司权益的尊重，也是对自身权益的保障。如果员工拒绝配合，可能会导致无法准确评估其工伤程度，进而影响其应得的工伤赔偿和待遇。此外，根据条例规定，工伤职工不配合再次鉴定的，可能会停止享受工伤保险待遇。

3. 公司的责任与措施：

   • 公司在提出再次鉴定申请时，应向员工明确说明再次鉴定的必要性和法律规定，以及员工配合的义务。如果员工拒绝配合，公司可以依据依法制定的规章制度对其采取相应的处理措施，如按旷工等违纪情形处罚。但同时，公司也应保留与员工的沟通记录，以备在后续纠纷中证明已合理要求员工配合鉴定。

4. 特殊情况的处理：

   • 如果公司提出再次鉴定申请的时间超过了规定的时限（如鉴定结论作出一年后），或者员工对再次鉴定的必要性存在合理质疑，那么员工有权拒绝配合。但这种情况需要具体分析，并依据相关法律法规和公司规章制度进行判断。

综上所述，在公司申请再次鉴定且符合法律规定的情况下，员工是需要配合的。这不仅是对公司权益的尊重，也是对自身权益的保障。如果员工拒绝配合，可能会面临相应的法律后果和权益损失。因此，建议员工在接到公司的再次鉴定要求时，积极了解相关法律法规和公司规章制度，并按照要求配合鉴定工作。