结论：公司因应聘者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘的行为，是不合法的。
分析：
从劳动合同法的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。这意味着，劳动合同的内容必须合法，且双方应在平等自愿的基础上进行协商。
- 如果公司提供的合同条款不合法（如违反法律法规、侵犯劳动者权益等），劳动者有权拒绝签署。公司不能因劳动者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘，否则将违反劳动合同法的原则。
从反就业歧视的角度：
- 就业歧视是指用人单位在招聘过程中，因劳动者的性别、年龄、种族、宗教信仰、残疾状况等因素而对其采取不公平的对待。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“因拒绝签署不合法合同而拒绝招聘”为就业歧视，但这种行为实质上是对劳动者合法权益的一种侵犯，违背了公平、公正的就业原则。
- 在实践中，如果公司因劳动者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘，且这种拒绝与劳动者的能力、资质等无关，那么这种行为很可能被视为一种变相的就业歧视。
从劳动者权益保护的角度：
- 劳动者在就业过程中享有平等的就业权利和选择职业的权利。公司不能因劳动者拒绝签署不合法合同而剥夺其就业机会，否则将侵犯劳动者的合法权益。
- 如果劳动者遇到这种情况，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于劳动者而言，如果遇到公司因拒绝签署不合法合同而拒绝招聘的情况，应首先保留好相关证据（如招聘广告、面试记录、合同文本等），然后向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应严格遵守劳动合同法的相关规定，确保提供的合同条款合法、合规。同时，应尊重劳动者的合法权益，不得因劳动者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘。
可能的法律后果：
- 如果公司因劳动者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘，且被认定为违法或就业歧视，那么公司可能面临劳动监察部门的处罚、劳动者的索赔以及声誉损失等法律后果。
综上所述，公司因应聘者拒绝签署不合法合同而拒绝招聘的行为是不合法的。劳动者在遇到这种情况时，应积极维护自己的合法权益。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。