结论：公司扣意外险和查体费是否合理需分情况讨论，一般情况下不合理，但存在特殊情形时可能合法。

1. 关于意外险费用扣除
   根据《劳动合同法》第九条及《社会保险法》相关规定，用人单位不得以任何名义向劳动者收取财物（押金、保证金等），但商业保险费用是否可扣除需区分性质：

   • 若意外险属于公司福利（即公司自愿为员工购买），费用应由公司承担，不得转嫁员工；
     
   • 若公司强制员工承担商业险费用，或以“不交钱就不续保”等理由变相收费，则涉嫌违法；
     
   • 例外情形：若劳动合同或规章制度中明确约定“员工需承担部分商业险费用”，且该约定不违反法律强制性规定（如未超出合理范围），可能被认定为合法，但实践中此类条款易因“显失公平”被认定无效。

2. 关于查体费（体检费）扣除
   体检费是否可扣需结合体检性质判断：

   • 入职体检：根据《就业服务与就业管理规定》，用人单位不得要求劳动者提供担保或以其他名义收取财物，入职体检费应由公司承担；
     
   • 在职定期体检：若体检属于公司福利或职业健康检查（如接触职业病危害的岗位），费用应由公司承担；
     
   • 特殊情形：若员工因个人原因（如申请特殊岗位需额外体检）产生的费用，且双方事先约定由员工承担，可能合法，但需符合“自愿、合理”原则。

3. 公司行为违法的后果
   若公司无正当理由扣除费用，员工可：

   • 向劳动监察部门投诉（要求责令退还费用）；
     
   • 申请劳动仲裁（主张返还费用并可能要求赔偿）；
     
   • 保留工资条、扣款通知等证据，以备维权。

建议：先与公司协商要求说明扣款依据，若协商无果，可携带劳动合同、扣款记录等材料向当地劳动监察大队投诉或申请仲裁。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。