在行政机关于诉讼中撤销处罚，而当事人要求确认违法的情况下，法院通常会作出如下处理：

1. 确认行政处罚行为违法：

   • 当行政处罚被撤销时，法院往往会判决确认该行政处罚行为违法。这是因为行政处罚的撤销本身就意味着该处罚行为在程序上或实体上存在不符合法定要求的情况，如证据不足、程序违法、超越职权等。确认违法是对行政处罚行为性质的一种明确界定，有助于维护法律的严肃性和当事人的合法权益。

2. 判决行政机关给予赔偿：

   • 若因该行政处罚给当事人造成了损失，法院会判决行政机关依法给予赔偿。这种赔偿通常包括直接经济损失，如因行政处罚导致的财产扣押、罚款等造成的损失，以及可能因行政处罚而产生的其他合理费用。赔偿的目的是为了弥补当事人因行政机关的违法行为而遭受的损失，恢复其合法权益。

3. 判决行政机关赔礼道歉：

   • 在存在错误拘留等侵犯人身权的情况下，法院可能会根据具体情节判决行政机关向当事人赔礼道歉。赔礼道歉不仅是对当事人人格尊严的一种尊重，也是对行政机关违法行为的一种道德谴责。它有助于缓解当事人因行政处罚而产生的心理压力和不满情绪，促进社会和谐稳定。

4. 判决行政机关采取补救措施：

   • 法院还可能判决行政机关采取相应的补救措施。例如，如果行政处罚错误地注销了当事人的某项行政许可，行政机关需重新为当事人办理相关许可手续，恢复当事人应有的权利状态。补救措施的目的是为了纠正行政机关的违法行为，使当事人的合法权益得到切实保障。

5. 要求行政机关规范执法：

   • 同时，法院会要求行政机关在今后作出行政行为时严格遵循法定程序，规范执法。这是为了防止类似违法行政行为再次发生，保障行政相对人的合法权益和行政行为的合法性、公正性。行政机关应当从中吸取教训，加强内部管理，提高执法水平，确保行政行为的合法性和有效性。

法律背景与建议：

• 在行政诉讼中，当事人有权要求法院对行政机关的违法行为进行确认，并寻求相应的法律救济。这是法律赋予当事人的一种重要权利，也是维护社会公平正义的重要途径。
• 如果您作为当事人遇到了类似的情况，建议您及时收集相关证据，如行政处罚决定书、撤销决定书、损失证明等，以便在诉讼中充分证明自己的主张。
• 同时，您也可以考虑咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据您的具体情况，为您制定合适的诉讼策略，维护您的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果法院判决确认行政处罚行为违法，并要求行政机关给予赔偿、赔礼道歉或采取补救措施，行政机关应当积极履行判决义务。否则，可能会面临更严重的法律后果，如被强制执行、承担额外的法律责任等。
• 对于当事人而言，如果法院支持了其诉讼请求，将有助于恢复其合法权益，并可能获得相应的经济赔偿和精神慰藉。这有助于缓解当事人的不满情绪，促进社会和谐稳定。