您好，针对您提出的“行政处罚书在行政复议后认定违法，当事人怎么申请撤销”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、撤销行政处罚的法律依据与情形

首先，需要明确的是，行政处罚的撤销通常基于以下几种情形：

1. 行政行为违法：如行政处罚决定存在主要证据不足、适用法律错误、违反法定程序、超越职权或滥用职权等情形，这些均可能构成行政处罚被撤销的法律依据。
2. 行政处罚不当：若行政处罚明显不当，例如处罚过重或过轻，与违法行为的事实、性质、情节以及社会危害程度不相适应，也可能导致行政处罚被撤销或变更。
3. 法律法规变更：若行政处罚所依据的法律、法规、规章等发生变更或废止，导致原处罚决定不再适用，该行政处罚亦应被撤销。

二、行政复议后认定违法的撤销流程

既然您提到行政处罚书已经在行政复议后被认定违法，那么接下来您可以按照以下步骤申请撤销：

1. 获取复议决定书：

   • 确保您已经收到了行政复议机关作出的复议决定书，并且该决定书明确认定原行政处罚违法。

2. 准备撤销申请材料：

   • 根据复议决定书的内容，准备撤销申请书，详细说明撤销的理由和依据。
   • 附上复议决定书作为证据，以及其他可能支持您撤销申请的证据材料，如新证据、证人证言等。

3. 向原作出行政处罚的行政机关提交撤销申请：

   • 将撤销申请书及相关证据材料提交给原作出行政处罚的行政机关。
   • 行政机关在收到申请后，会进行内部审查，并根据审查结果作出是否撤销的决定。

4. 等待行政机关的处理结果：

   • 行政机关在收到撤销申请后，通常会在一定期限内（如30日或60日，具体根据当地规定）作出处理决定。
   • 如果行政机关同意撤销原行政处罚，会制作撤销行政处罚决定书，并送达给您。

5. 若行政机关不同意撤销，可考虑进一步法律途径：

   • 如果行政机关不同意撤销原行政处罚，您可以考虑向人民法院提起行政诉讼，请求法院判决撤销该行政处罚。
   • 在提起行政诉讼前，建议您咨询专业律师，以了解诉讼风险和策略。

三、注意事项

1. 时效性：

   • 撤销行政处罚的申请通常需要在法定的期限内提出，超过期限可能会丧失撤销的权利。因此，请务必关注相关时效规定，并及时提出申请。

2. 证据充分：

   • 在提出撤销申请时，应提供充分的证据来支持您的主张。证据应真实、合法、有效，并能够证明原行政处罚存在违法或不当情形。

3. 遵循程序：

   • 无论是向行政机关提出撤销申请还是向人民法院提起行政诉讼，都应严格遵守法定的程序和规定。确保您的申请或诉讼符合法律要求，以提高撤销的成功率。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在撤销过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询专业律师或相关法律机构。