判断综合工时制下工作时间是否违法，主要需从法律依据与审批程序、适用对象与范围、实施条件与要求以及监督管理与法律责任四个方面进行考量：

1. 法律依据与审批程序

   • 法律依据：综合计算工时工作制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。其法律依据主要来源于《中华人民共和国劳动法》第三十九条以及原劳动部《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》（劳部发〔1994〕503号）等相关规定。
   • 审批程序：企业实行综合计算工时工作制，必须经过劳动行政部门审批。未经审批，企业不得擅自实行。审批过程中，企业需要提交相关材料，如申请书、实施方案、工时管理及工资支付规章制度等，以证明其符合实行综合计算工时工作制的条件。若企业未经审批擅自实行，则构成违法。

2. 适用对象与范围

   • 适用对象：综合计算工时工作制主要适用于交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业中因工作性质特殊，需连续作业的职工；地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业的部分职工；以及其他适合实行综合计算工时工作制的职工。若企业将不适用于综合计算工时工作制的岗位或人员纳入其中，则可能构成违法。
   • 适用范围：企业应明确哪些岗位和人员适用综合计算工时工作制，并在劳动合同中明确约定或在规章制度中规定。对于新入职员工或岗位调整的员工，应及时告知并签订补充协议。若企业未明确适用范围或未及时告知员工，则可能引发劳动纠纷。

3. 实施条件与要求

   • 实施条件：企业必须确保在综合计算周期内，劳动者的平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。即，虽然某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过法定标准工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应符合法定工作时间的要求。若企业未满足此条件，则可能构成违法。
   • 实施要求：企业应制定科学合理的综合计算工时工作制实施方案，包括工时计算方式、考勤管理、休息休假安排等内容。同时，企业应建立健全工时管理制度，准确记录劳动者的工作时间，包括出勤、加班、请假等情况。在综合计算周期内，如果总实际工作时间超过总法定标准工作时间，企业应按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资；如果在法定节假日安排劳动者工作的，应按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。若企业未满足这些实施要求，则可能构成违法。

4. 监督管理与法律责任

   • 监督管理：劳动行政部门应加强对企业实行综合计算工时工作制的监督检查，确保其合法合规实施。企业应定期向劳动行政部门报告综合计算工时工作制的执行情况，接受社会监督。若企业未接受监督管理或未报告执行情况，则可能面临行政处罚。
   • 法律责任：如果企业未经审批擅自实行综合计算工时工作制，或者实施过程中存在违法行为（如超时加班未支付加班工资、法定节假日安排工作未支付三倍工资等），劳动行政部门将依法追究其法律责任。劳动者也有权对用人单位的违法行为进行举报和投诉，维护自己的合法权益。

具体判断方法：

• 首先，核查企业是否已获得劳动行政部门的审批，并确认审批材料是否齐全、合规。
• 其次，核查企业是否明确适用了综合计算工时工作制的岗位和人员，并在劳动合同或规章制度中进行了明确约定。
• 再次，核查企业在综合计算周期内是否确保了劳动者的平均日工作时间和平均周工作时间与法定标准工作时间基本相同，并是否准确记录了劳动者的工作时间。
• 最后，核查企业在总实际工作时间超过总法定标准工作时间时是否支付了加班工资，以及在法定节假日安排劳动者工作时是否支付了三倍工资。

若企业在以上任何一方面存在违法行为，则可判断其综合工时制下的工作时间违法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。