与分公司签订的劳动合同，在申请劳动仲裁时，被申请人通常是分公司；但如果分公司不具有独立法人资格，则被申请人可能是总公司。以下是对此问题的详细分析：

一、分公司具有独立法人资格的情况

1. 法律地位：如果分公司依法取得了营业执照，并具有独立的经营场所和财产，那么它在法律上具有一定的独立地位。这种情况下，分公司可以独立承担民事责任。

2. 仲裁被申请人：在与分公司签订劳动合同的情况下，如果发生劳动争议，且分公司具有独立法人资格，那么劳动者在申请劳动仲裁时，可以将分公司作为被申请人。

二、分公司不具有独立法人资格的情况

1. 法律地位：如果分公司没有取得独立的营业执照，或者虽然取得了营业执照但没有独立的财产和经营场所，那么它在法律上可能不具有独立的民事责任能力。这种情况下，分公司的民事责任通常由总公司承担。

2. 仲裁被申请人：

   • 直接列总公司为被申请人：在与分公司签订劳动合同的情况下，如果发生劳动争议，且分公司不具有独立法人资格，那么劳动者在申请劳动仲裁时，通常需要将总公司列为被申请人。因为分公司无法独立承担民事责任，其责任应由总公司承担。
   • 同时列分公司和总公司为被申请人：在某些情况下，为了更全面地保障劳动者的权益，劳动者也可以选择同时将分公司和总公司列为被申请人。这样做的好处是，如果仲裁机构或法院认为分公司具有一定的责任能力，可以要求分公司承担相应的责任；如果分公司无法承担全部责任，则可以要求总公司承担剩余的责任。

三、实际操作建议

1. 了解分公司情况：在申请劳动仲裁前，劳动者应了解分公司的法律地位和财产状况，以便确定合适的被申请人。

2. 咨询专业律师：由于劳动仲裁涉及复杂的法律问题和程序，劳动者在申请前最好咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况为劳动者提供合适的法律建议和策略。

3. 准备充分证据：无论选择哪个作为被申请人，劳动者都需要准备充分的证据来支持自己的仲裁请求。这些证据可能包括劳动合同、工资单、考勤记录、工作证等。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供合适的法律建议和策略。