结论前置：针对“食品安全员有任命书但不干了”的情况，可以从法律责任、后续处理及预防措施三个角度进行分析。
一、法律责任角度
合同义务：
- 食品安全员若与公司签订了劳动合同或相关服务协议，并明确约定了服务期限和职责，那么其擅自离职可能构成违约。根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金（但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用）。
- 若食品安全员的离职行为给公司造成了经济损失，如因食品安全问题导致的罚款、赔偿等，公司有权要求其承担相应的赔偿责任。
食品安全责任：
- 食品安全员在任期间，若因其过失或故意行为导致食品安全事故，即使其已离职，仍可能需承担相应的法律责任。这包括行政责任（如罚款、吊销许可证等）和民事责任（如赔偿受害者损失）。
- 若食品安全员在离职前未妥善履行交接义务，导致公司无法及时采取补救措施，进而引发食品安全问题，其也可能需承担一定的责任。
二、后续处理角度
协商解决：
- 公司可以与食品安全员进行协商，了解其离职原因，并尝试达成和解。若双方能够就违约责任、赔偿等问题达成一致，可以签订书面协议以明确双方的权利和义务。
法律途径：
- 若协商无果，公司可以依据劳动合同或相关服务协议的约定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求食品安全员承担违约责任或赔偿责任。
- 在诉讼过程中，公司需要提供充分的证据证明食品安全员的违约行为或过失行为，以及因此造成的损失。
交接与替代：
- 公司应尽快安排其他人员接替食品安全员的职责，确保食品安全管理工作的连续性和有效性。
- 同时，公司应要求离职的食品安全员妥善交接相关工作资料、文件等，以便接替人员能够迅速熟悉工作。
三、预防措施角度
完善合同条款：
- 公司在与食品安全员签订劳动合同时，应明确约定服务期限、职责、违约责任等条款，以降低其擅自离职的风险。
加强培训与管理：
- 公司应定期对食品安全员进行培训，提高其食品安全意识和法律意识。
- 同时，公司应建立健全的食品安全管理制度，明确各级人员的职责和权限，确保食品安全管理工作的有效实施。
建立应急机制：
- 公司应建立食品安全应急机制，明确在食品安全员离职等突发情况下应采取的措施和流程，以确保能够迅速应对并降低损失。
总结与建议：针对食品安全员有任命书但不干了的情况，公司应首先评估其法律责任，包括合同义务和食品安全责任；其次，通过协商或法律途径解决后续问题；最后，采取预防措施以降低类似风险的发生。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。