使用假医生证上班所得工资属于违法所得，依法应当予以没收，同时行为人还可能面临行政处罚甚至刑事处罚，不存在“合法计算工资”的说法。以下从不同法律角度为您详细分析：
1. 行政处罚层面
根据《中华人民共和国医师法》第五十六条，未取得医师执业证书从事诊疗活动的，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令停止非法执业活动，没收违法所得和药品、医疗器械，并处违法所得二倍以上十倍以下的罚款，违法所得不足一万元的，按一万元计算。
关键点：
- 工资属于“违法所得”，必须全额没收；
- 罚款基数为违法所得的2-10倍（最低1万元起罚）；
- 即使未造成实际危害，只要实施了非法执业行为，即构成违法。
2. 刑事处罚层面
若行为构成犯罪，需承担刑事责任：
- 非法行医罪（《刑法》第三百三十六条）：未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；严重损害就诊人身体健康的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。
- 关键情节：包括多次非法行医、造成患者轻度残疾或器官组织损伤、使用假药或劣药等。
工资处理：刑事案件中，违法所得同样会被追缴，且可能面临罚金附加刑。
3. 劳动关系层面
从劳动法角度，使用假证签订的劳动合同无效：
- 根据《劳动合同法》第二十六条，以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下订立的劳动合同无效；
- 无效劳动合同自始没有法律约束力，劳动者无权要求支付工资，且用人单位可要求赔偿因欺诈造成的损失（如招聘成本、医疗纠纷赔偿等）。
例外情形：若用人单位明知劳动者无资质仍录用，可能被认定为共同违法，但劳动者仍需承担主要责任。
4. 民事赔偿层面
若因非法行医导致患者损害，行为人需承担全部民事赔偿责任：
- 赔偿范围包括医疗费、误工费、残疾赔偿金等；
- 用人单位若存在过错（如未审核资质），可能承担连带责任，但劳动者作为直接侵权人，最终责任难以免除。
总结建议
- 立即停止非法执业行为，避免行政处罚升级为刑事犯罪；
- 主动退还违法所得，争取从轻处理；
- 若已涉及刑事风险，建议尽快委托律师介入，争取取保候审或缓刑；
- 未来从事医疗行业，必须通过正规考试取得执业资格。
法律风险提示：假医生证不仅导致工资“归零”，还可能面临高额罚款、自由刑甚至终身禁业，切勿因小失大。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。