针对您提出的“员工早上打卡就跑了是否违法以及如何处理”的问题，我们可以从法律和企业管理的角度进行详细分析。

一、是否违法

员工早上打卡后立即离开，若此行为构成了迟到早退或旷工，并且违反了公司的规章制度，那么从公司管理的角度来看，这种行为是不被允许的。但单纯从“打卡就跑”这一行为本身，并不能直接判定为违法，除非它违反了具体的法律法规或公司规章制度，且这些规章制度是合法、合理并经过公示的。

1. 违反公司规章制度：如果公司有明确的考勤制度，规定员工必须在规定时间内完成工作，而员工却打卡后立即离开，这明显违反了公司的规章制度。

2. 不构成直接违法：然而，这种行为本身并不直接构成违法，除非它导致了公司经济损失或其他严重后果，并且这些后果与员工的打卡就跑行为有直接的因果关系。

二、如何处理

对于员工早上打卡就跑了的行为，公司可以采取以下措施进行处理：

1. 核实情况：

   • 首先，公司应核实员工的打卡记录和实际出勤情况，确认是否存在迟到早退或旷工的行为。
   • 可以通过查看监控录像、询问其他员工或要求员工提供解释等方式进行核实。

2. 依据规章制度处理：

   • 如果确认员工存在违反规章制度的行为，公司应依据规章制度进行相应的处理。
   • 规章制度应明确规定迟到早退、旷工等行为的处罚措施，如扣款、警告、解雇等。

3. 合理、善意和限度原则：

   • 公司在处理此类问题时，应遵循合理、善意和限度的原则。
   • 不能仅凭一次或几次的打卡就跑行为就轻易解雇员工，而应考虑员工的整体表现、工作态度以及是否有改过自新的可能。

4. 法律途径：

   • 如果员工的行为严重违反了公司规章制度，且给公司造成了重大损失，公司可以考虑通过法律途径解决。
   • 但在此之前，公司应确保自己的规章制度是合法、合理并经过公示的，且处理过程符合法律法规的要求。

5. 预防措施：

   • 为了避免类似情况的发生，公司可以加强考勤管理，如采用更先进的考勤系统、加强员工培训等。
   • 同时，公司也可以考虑建立更完善的激励机制，鼓励员工积极工作、遵守规章制度。

三、案例参考

从提供的参考信息中，我们可以看到两个案例：

1. 何某案例：何某因多次迟到早退被公司开除，法院认定公司行为并无不当。这说明，如果公司有明确的规章制度，并且员工多次违反，公司有权解除劳动合同。

2. 李某案例：李某虽然迟到几次，但也有提前上班和加班记录。法院认为公司在处理时未遵循合理、善意和限度原则，最终经调解公司支付了经济赔偿金。这说明，公司在处理员工违纪行为时，应综合考虑各种因素，不能一概而论。

综上所述，对于员工早上打卡就跑了的行为，公司应首先核实情况，然后依据规章制度进行合理、善意的处理。同时，公司也应加强考勤管理和员工培训，以预防类似情况的发生。