结论：在合伙工程中，若合同是另一方签订，而发包商不按合同付款，一方是否有权停工需视具体情况而定，一般情况下，若发包商未支付相应工程款或提供适当担保，承包人有权停工保护自己的利益，但需注意合同中是否有特别约定。

一、有权停工的情况

根据最高院的判例，如《朝阳中贸商业城开发有限公司与江苏南通二建集团有限公司等建设工程施工合同纠纷案》，在建设工程施工合同履行过程中，若发包人未支付相应工程款或提供适当担保，承包人有权依法停止施工，以保护自己的利益。特别是在承包人起诉后，发包人仍未支付相应工程款或提供适当担保的情况下，承包人依法停止施工是保护自己合法权益的行为。

具体分析：

• 发包商违约：发包商未按合同约定支付工程款，构成违约。
• 承包人权益保护：承包人有权采取合理措施保护自己的利益，包括停工。
• 法律依据：相关判例明确支持承包人在发包商违约时的停工权利。

二、无权停工的情况

然而，如果合同中有特别约定，如短期内发包方欠付工程款时承包人不得停工、怠工，则该约定有效。在此情况下，承包人向发包人主张停工损失可能与约定不符，不予支持。例如，在《四川省第一建筑工程有限公司诉云南万都房地产开发有限公司等建设工程施工合同纠纷案》中，法院明确指出，若合同中有此类约定，承包人以发包人未足额支付工程进度款为由主张停工损失将不予支持。

具体分析：

• 合同特别约定：合同中可能包含对停工、怠工的特别限制。
• 约定效力：此类约定在合同中有效，对双方具有约束力。
• 法律后果：承包人违反约定停工，可能无法获得法律支持。

三、停工损失的承担

若承包人有权停工，并因此造成了损失，除非有证据证明停工损失是由承包人自身原因导致，否则发包人应承担该损失。例如，在《浙江宏成建设集团有限公司诉宁夏瑞泰房地产开发有限公司建设工程施工合同纠纷案》中，法院明确指出，发包方仅支付部分建设工程进度款，导致工期延误，承包人停工，因此造成的损失应由发包人承担。

具体分析：

• 损失原因：停工损失需非承包人自身原因导致。
• 责任承担：发包人应承担因未支付工程款导致的停工损失。
• 证据要求：承包人需提供证据证明损失与发包人违约的关联性。

四、建议与注意事项

1. 审查合同条款：在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于付款、停工、怠工以及违约责任的约定。
2. 保留证据：在施工过程中，应保留好与发包商沟通、催款以及停工的相关证据，以备不时之需。
3. 及时咨询：若遇到发包商不按合同付款的情况，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。

总结：在合伙工程中，若合同是另一方签订，而发包商不按合同付款，一方是否有权停工需根据合同条款和具体情况来判断。若合同无特别约定，且发包商构成违约，承包人有权停工保护自己的利益。但无论如何，都应谨慎行事，并咨询专业律师以获取更准确的法律建议。若您有任何法律问题，都可以直接向我咨询。