针对您提出的“工伤申请康复锻炼，鉴定结果不予批准的费用由谁来承担”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确的是，工伤康复费用的承担通常与工伤认定、工伤保险参保情况以及工伤发生的具体情形紧密相关。在一般情况下，如果工伤已经得到明确认定，并且职工已经参加了工伤保险，那么在工伤康复期间产生的符合相关规定的费用，如住院期间的伙食补助以及工伤康复中心为了使工伤职工得到更好地治疗而需要的费用，通常将由工伤保险基金来支付。

然而，您提到的情况是“鉴定结果不予批准”，这可能意味着工伤康复锻炼的申请并未被认定为必要的工伤康复治疗，或者不符合工伤保险的相关规定。在这种情况下，费用的承担将取决于几个关键因素：

1. 是否参加工伤保险：

   • 如果职工已经参加了工伤保险，但康复锻炼的申请未被批准，且该费用不属于工伤保险基金支付的范围（例如，选择了非签订服务协议的医疗机构或使用了非目录内的康复项目和药品），那么这部分费用可能无法由工伤保险基金承担。此时，如果用人单位认为该康复锻炼对职工的恢复是必要的，并且愿意承担费用，那么可以由用人单位支付。但如果用人单位不认为有必要，或者双方无法达成一致，那么这部分费用可能需要由职工本人承担。

2. 未参加工伤保险的情况：

   • 如果职工未参加工伤保险，且康复锻炼的申请未被批准，那么根据《工伤保险条例》的相关规定，用人单位未履行法定义务为职工缴纳工伤保险，因此需承担全部工伤康复费用（如果认定该费用为必要）的责任将不存在，因为申请本身未被批准。在这种情况下，如果职工坚持进行康复锻炼，那么费用将需要由职工本人承担。

3. 特殊情况：

   • 如果存在职工故意自残、醉酒或吸毒导致工伤（但此情况已超出“工伤”范畴，通常不享受工伤保险待遇），或者雇主未及时提出工伤认定申请（但此情况与“鉴定结果不予批准”不完全对应）等特殊情形，费用的承担将根据具体情况和相关法律法规进行判断。但在您提出的问题中，这些特殊情况并不直接适用。

总结与建议：

在工伤申请康复锻炼鉴定结果不予批准的情况下，费用的承担将主要取决于职工是否参加工伤保险以及康复锻炼的必要性和合理性。如果职工已经参加了工伤保险，但康复锻炼的申请未被批准且费用不属于工伤保险基金支付范围，那么费用可能需要由职工本人或用人单位（如果认为有必要）承担。如果职工未参加工伤保险，且申请未被批准，那么费用将需要由职工本人承担。

因此，建议您在处理此类问题时，首先仔细审查工伤认定的结果和康复锻炼的必要性，然后与用人单位进行充分沟通，看是否能够达成一致意见。如果无法达成一致，您可以考虑咨询专业的法律人士或劳动争议调解机构，以获取更具体的指导和帮助。